RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 STAMQ92783 540 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 RMND1Q9NWS8 449 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 SRRDQ9UH36 339 aa22.16■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 NFASCO94856 1347 aa22.16■■□□□ 1.14
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CLN8-208ENST00000635751 STAT6P42226 847 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 KRT79Q5XKE5 535 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 SCFD2Q8WU76 684 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 IGHA2P01877 340 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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CLN8-208ENST00000635751 TTLL4Q14679 1199 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 PTPN21Q16825 1174 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 TMEM139Q8IV31 216 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 PLIN2Q99541 437 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 MTRQ99707 1265 aa22.15■■□□□ 1.14
CLN8-208ENST00000635751 DISC1Q9NRI5 854 aa22.15■■□□□ 1.14
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CLN8-208ENST00000635751 NEDD9Q14511 834 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.14■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 CENPFP49454 3210 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 CCNE2O96020 404 aa22.13■■□□□ 1.13
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CLN8-208ENST00000635751 SP4Q02446 784 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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CLN8-208ENST00000635751 TRIB2Q92519 343 aa22.13■■□□□ 1.13
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CLN8-208ENST00000635751 ECM1Q16610 540 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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CLN8-208ENST00000635751 COPS5Q92905 334 aa22.13■■□□□ 1.13
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CLN8-208ENST00000635751 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.13■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 SAMM50Q9Y512 469 aa22.13■■□□□ 1.13
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CLN8-208ENST00000635751 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.12■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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CLN8-208ENST00000635751 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.11■■□□□ 1.13
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CLN8-208ENST00000635751 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.11■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.1■■□□□ 1.13
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CLN8-208ENST00000635751 PLCG1P19174 1290 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 PAK1Q13153 545 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 DYDC2Q96IM9 177 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 STK24Q9Y6E0 443 aa22.1■■□□□ 1.13
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