RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL10Q6JEL2 608 aa27.67■■■□□ 2.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 HPS3Q969F9 1004 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-215ENST00000628018 HSD3B7Q9H2F3 369 aa27.67■■■□□ 2.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa27.67■■■□□ 2.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.64■■■□□ 2.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa27.64■■■□□ 2.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 CFHR5Q9BXR6 569 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-215ENST00000628018 NOP56O00567 594 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM13AO94988 1023 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF18P17022 549 aa27.59■■■□□ 2.01
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