RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 F5H6K3 240 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 CETN3O15182 167 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFB10O96000 172 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 ICA1Q05084 483 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 KLRC3Q07444 240 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 EMBQ6PCB8 327 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 GJB7Q6PEY0 223 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 ZIM3Q96PE6 472 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 NFU1Q9UMS0 254 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 PAFAH1B1P43034 410 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 JAM2P57087 298 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC70Q6NSX1 233 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 IDI2Q9BXS1 227 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 SLC35C1Q96A29 364 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 BORCS6Q96GS4 357 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 RGL1Q9NZL6 768 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PRG0 241 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TBX3O15119 743 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 NPR1P16066 1061 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PTPROQ16827 1216 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 KRT12Q99456 494 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 AMNQ9BXJ7 453 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ANKRD65E5RJM6 399 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TGFB1I1O43294 461 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ECHS1P30084 290 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CIITAP33076 1130 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GUCY2DQ02846 1103 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 USP38Q8NB14 1042 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ZBTB39O15060 712 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RAD51CO43502 376 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM37O94972 964 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 NR3C1P04150 777 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 DACT2Q5SW24 774 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GMCL1Q96IK5 515 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 WDR18Q9BV38 432 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 NAGPAQ9UK23 515 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 DNM3Q9UQ16 869 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF233A6NK53 670 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SFI1A8K8P3 1242 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PDXKO00764 312 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CLIC2O15247 247 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PPFIA4O75335 1185 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 IRAK1P51617 712 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 FBXO11Q86XK2 927 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RNF14Q9UBS8 474 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 KRT14P02533 472 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PRKCIP41743 596 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 NNTQ13423 1086 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 IQCKQ8N0W5 287 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 FIZ1Q96SL8 496 aa14.63□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 EPS15P42566 896 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 COG2Q14746 738 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 KSR1Q8IVT5 923 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 KIF4AO95239 1232 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ERVK-9P63128 1117 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ALS2CLQ60I27 953 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.62□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 FAM20AQ96MK3 541 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms