RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 ATP4AP20648 1035 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 JAK3P52333 1124 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 IGBP1P78318 339 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 FAM26DQ5JW98 314 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 CNKSR3Q6P9H4 555 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 GJA10Q969M2 543 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 C8orf76Q96K31 380 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 FAM20AQ96MK3 541 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 UNC45AQ9H3U1 944 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 KCNMB3Q9NPA1 279 aa28.11■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 COL1A2P08123 1366 aa28.1■■■□□ 2.09
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PMS1-220ENST00000618056 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 MCM2P49736 904 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 FOSBP53539 338 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 Q7L0L9 218 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 COL6A3P12111 3177 aa28.1■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 TMEM265A0A087WTH1 108 aa28.09■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 TBX3O15119 743 aa28.09■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 RSPH3Q86UC2 560 aa28.09■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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PMS1-220ENST00000618056 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.09■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 DNAJB2P25686 324 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 ZNF697Q5TEC3 545 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 FAM184AQ8NB25 1140 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 CHD7Q9P2D1 2997 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 CTSHP09668 335 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 TMX3Q96JJ7 454 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 FAM167AQ96KS9 214 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 PBX4Q9BYU1 374 aa28.08■■■□□ 2.09
PMS1-220ENST00000618056 CHMP2AO43633 222 aa28.07■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.07■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 MTHFD1LQ6UB35 978 aa28.07■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 MIER3Q7Z3K6 550 aa28.07■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 CKAP2LQ8IYA6 745 aa28.07■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa28.07■■■□□ 2.08
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PMS1-220ENST00000618056 SLC9A7Q96T83 725 aa28.07■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 MTMR10Q9NXD2 777 aa28.07■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.06■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 ZBTB42B2RXF5 422 aa28.06■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 EFCAB14O75071 495 aa28.06■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 CHRNA1P02708 482 aa28.06■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 GUCY1B3Q02153 619 aa28.06■■■□□ 2.08
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PMS1-220ENST00000618056 HAS1Q92839 578 aa28.06■■■□□ 2.08
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PMS1-220ENST00000618056 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 SEMA6BQ9H3T3 888 aa28.04■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.04■■■□□ 2.08
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PMS1-220ENST00000618056 UGCGQ16739 394 aa28.03■■■□□ 2.08
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PMS1-220ENST00000618056 NME8Q8N427 588 aa28.03■■■□□ 2.08
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PMS1-220ENST00000618056 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 IER5Q5VY09 327 aa28.02■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 SEPT8Q92599 483 aa28.02■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 OSBPL7Q9BZF2 842 aa28.02■■■□□ 2.08
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PMS1-220ENST00000618056 KIF3AQ9Y496 699 aa28.02■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa28.02■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.02■■■□□ 2.08
PMS1-220ENST00000618056 EML1O00423 815 aa28.01■■■□□ 2.07
PMS1-220ENST00000618056 BAG4O95429 457 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
PMS1-220ENST00000618056 C22orf31O95567 290 aa28.01■■■□□ 2.07
PMS1-220ENST00000618056 APBB2Q92870 758 aa28.01■■■□□ 2.07
PMS1-220ENST00000618056 WNT7AO00755 349 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-220ENST00000618056 MARCH6O60337 910 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-220ENST00000618056 RABGGTBP53611 331 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-220ENST00000618056 SPIRE1Q08AE8 756 aa28■■■□□ 2.07
PMS1-220ENST00000618056 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
PMS1-220ENST00000618056 HERC6Q8IVU3 1022 aa28■■■□□ 2.07
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