RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.2■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-209ENST00000616395 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-209ENST00000616395 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC3-209ENST00000616395 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.2■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-209ENST00000616395 UBE3AQ05086 875 aa20.19■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-209ENST00000616395 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM186AA6NE01 2351 aa20.19■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-209ENST00000616395 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.17■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-209ENST00000616395 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.17■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-209ENST00000616395 KLRF2D3W0D1 207 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF213O14771 459 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-209ENST00000616395 STAM2O75886 525 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-209ENST00000616395 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC3-209ENST00000616395 RNF20Q5VTR2 975 aa20.16■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.14■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-209ENST00000616395 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.14■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-209ENST00000616395 MCM2P49736 904 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-209ENST00000616395 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-209ENST00000616395 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-209ENST00000616395 PIGSQ96S52 555 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-209ENST00000616395 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC3-209ENST00000616395 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-209ENST00000616395 HIDE1A8MVS5 230 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-209ENST00000616395 M0QZ92 97 aa20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.11■□□□□ 0.81
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