RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC26A2P50443 739 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 JAK3P52333 1124 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 SPIRE1Q08AE8 756 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP2R5CQ13362 524 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 NBR1Q14596 966 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PLCB4Q15147 1175 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 CALCRLQ16602 461 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TTC38Q5R3I4 469 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 SLFN12Q8IYM2 578 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 LMBR1Q8WVP7 490 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM60Q9H2L4 133 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PRO3102Q9H379 93 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 NOD1Q9Y239 953 aa12.77□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TANC1Q9C0D5 1861 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 EML1O00423 815 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TREHO43280 583 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PDCP20941 246 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 SYT1P21579 422 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP2C18P33260 490 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF174Q15697 407 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM160B1Q5W0V3 765 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 MFSD5Q6N075 450 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PDXDC2PQ6P474 469 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 MIER3Q7Z3K6 550 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 RDM1Q8NG50 284 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP6V0A1Q93050 837 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 WNT8BQ93098 351 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 WNT8AQ9H1J5 351 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 GABBR1Q9UBS5 961 aa12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 POTEB3A0JP26 581 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF862O60290 1169 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 MARCH6O60337 910 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 BAG4O95429 457 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 INSRRP14616 1297 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PPFIA1Q13136 1202 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PTK7Q13308 1070 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 GRIK4Q16099 956 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 UGCGQ16739 394 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 MARCH8Q5T0T0 291 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 POTEBQ6S5H4 581 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 SERINC5Q86VE9 423 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP8B4Q8TF62 1192 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 HS3ST6Q96QI5 342 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PCDHA12Q9UN75 941 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 SCN5AQ14524 2016 aa12.75□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 GNAT1P11488 350 aa12.74□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 BMP8BP34820 402 aa12.74□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TXKP42681 527 aa12.74□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 CCL23P55773 120 aa12.74□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 RBL2Q08999 1139 aa12.74□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 RILPL1Q5EBL4 403 aa12.74□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 C4orf32Q8N8J7 132 aa12.74□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 CAGE1Q8TC20 777 aa12.74□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 ZBTB42B2RXF5 422 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 HBP1O60381 514 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 OR52Z1P0C646 297 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 IQCF3P0C7M6 154 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 CKBP12277 381 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 CSF2RAP15509 400 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 EPHB4P54760 987 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 IGBP1P78318 339 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 FPGSQ05932 587 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 BFSP2Q13515 415 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 NCAPH2Q6IBW4 605 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 FERMT3Q86UX7 667 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 CKAP2LQ8IYA6 745 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM199Q8N511 208 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 BANK1Q8NDB2 785 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 ZBTB10Q96DT7 871 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 SCLYQ96I15 445 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TUBE1Q9UJT0 475 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 MTMR6Q9Y217 621 aa12.73□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 LAMA3Q16787 3333 aa12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 RRN3P2A6NIE6 340 aa12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 STX6O43752 255 aa12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 STBD1O95210 358 aa12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 OATP04181 439 aa12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PRKCEQ02156 737 aa12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PTGDRQ13258 359 aa12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 EPHA7Q15375 998 aa12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAF7Q6Q0C0 670 aa12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 RUFY4Q6ZNE9 571 aa12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 BRAPQ7Z569 592 aa12.72□□□□□ -0.37
CCL3L3-201ENST00000612839 CCDC155Q8N6L0 562 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms