RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 FBRSQ9HAH7 460 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 VEZTQ9HBM0 779 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 FOCADQ5VW36 1801 aa6.64□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 TCP10L2B9ZVM9 353 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 GDNFP39905 211 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 TIMM10P62072 90 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ATP2B3Q16720 1220 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MFSD4AQ8N468 514 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 LPIN2Q92539 896 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.63□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 NCANO14594 1321 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 GAKO14976 1311 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 UNCXA6NJT0 531 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 NFIBO00712 420 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 LRIG2O94898 1065 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 TFCP2Q12800 502 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MOGSQ13724 837 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 RASGRF1Q13972 1273 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 VGLL4Q14135 290 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 FAM83AQ86UY5 434 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 RGS22Q8NE09 1264 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MIPEPQ99797 713 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SZT2Q5T011 3432 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.62□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 A0A1B0GUL7 405 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SLC5A1P13866 664 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 NF2P35240 595 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 IL15P40933 162 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 NKG7Q16617 165 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 KCT2Q8NC54 265 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 RIN3Q8TB24 985 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 TEKT1Q969V4 418 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 OPTNQ96CV9 577 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 DOCK1Q14185 1865 aa6.61□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 AK9Q5TCS8 1911 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MGAMO43451 1857 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SRGAP3O43295 1099 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 MYO1BO43795 1136 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 PF4P02776 101 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 RHBDL3P58872 404 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SREBF2Q12772 1141 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 CRHR2Q13324 411 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 SSH3Q8TE77 659 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 FAM151AQ8WW52 585 aa6.6□□□□□ -1.35
HERC3-212ENST00000597259 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms