RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PCYT2Q99447 389 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 MAP3K14Q99558 947 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 JADE2Q9NQC1 790 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PADI3Q9ULW8 664 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 GINS2Q9Y248 185 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 CCDC69A6NI79 296 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 EYA4O95677 639 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 GLP2RO95838 553 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 COASYQ13057 564 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 TRIM67Q6ZTA4 783 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PRSS33Q8NF86 280 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PHOX2BQ99453 314 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 SDF4Q9BRK5 362 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 SMARCA1P28370 1054 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 ACTR2P61160 394 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 KRT76Q01546 638 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PLCB4Q15147 1175 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 TMX1Q9H3N1 280 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 TLE6Q9H808 572 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 SQORQ9Y6N5 450 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PER2O15055 1255 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 SGSM2O43147 1006 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 STAT5BP51692 787 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PTPN5P54829 565 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 ZXDAP98168 799 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 IER5LQ5T953 404 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PGBD1Q96JS3 809 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 C5orf42Q9H799 3197 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 DENND3A2RUS2 1198 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 MAFGO15525 162 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 CALM1P0DP23 149 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 CALM2P0DP24 149 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 CALM3P0DP25 149 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 MCM5P33992 734 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 TLR9Q9NR96 1032 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 AAASQ9NRG9 546 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 HCSTQ9UBK5 93 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 TECTAO75443 2155 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 BACH1O14867 736 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 MGEA5O60502 916 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 FGF18O76093 207 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 MICU3Q86XE3 530 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 MAP4K1Q92918 833 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM87BQ96K49 555 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 TTC3P53804 2025 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 NFASCO94856 1347 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.9□□□□□ -0.02
NEDD4L-232ENST00000591579 RPS6KA5O75582 802 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD4L-232ENST00000591579 ARP10275 920 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD4L-232ENST00000591579 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NEDD4L-232ENST00000591579 KLRC1P26715 233 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD4L-232ENST00000591579 NAPAP54920 295 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD4L-232ENST00000591579 UBE3AQ05086 875 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD4L-232ENST00000591579 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NEDD4L-232ENST00000591579 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NEDD4L-232ENST00000591579 PKN1Q16512 942 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD4L-232ENST00000591579 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms