RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 EML1O00423 815 aa22.61■■□□□ 1.21
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ATG4D-208ENST00000588667 POTEBQ6S5H4 581 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4D-208ENST00000588667 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4D-208ENST00000588667 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4D-208ENST00000588667 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.61■■□□□ 1.21
ATG4D-208ENST00000588667 LAD1O00515 517 aa22.6■■□□□ 1.21
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ATG4D-208ENST00000588667 HIPK3Q9H422 1215 aa22.6■■□□□ 1.21
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ATG4D-208ENST00000588667 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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ATG4D-208ENST00000588667 COL1A2P08123 1366 aa22.58■■□□□ 1.21
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ATG4D-208ENST00000588667 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4D-208ENST00000588667 POTEMA6NI47 508 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 OATP04181 439 aa22.57■■□□□ 1.2
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ATG4D-208ENST00000588667 RAB34Q9BZG1 259 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 RGL1Q9NZL6 768 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 CYP4A11Q02928 519 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ATG4D-208ENST00000588667 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
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