RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588516.5

NEDD4L-223, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 1,304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	GFPT2	O94808	682 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	RPA1	P27694	616 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	CRK	P46108	304 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	EPHB4	P54760	987 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADAM9	Q13443	819 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZSCAN26	Q16670	478 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	UBE2S	Q16763	222 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	GBP6	Q6ZN66	633 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	FBXO11	Q86XK2	927 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	CREG2	Q8IUH2	290 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	IFT20	Q8IY31	132 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		15.43	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	ADM5	C9JUS6	153 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	CAPN2	P17655	700 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	CIITA	P33076	1130 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	MMP14	P50281	582 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	NAB2	Q15742	525 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC18A3	Q16572	532 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	TAF4B	Q92750	862 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAM107B	Q9H098	131 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		15.42	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	UBE4B	O95155	1302 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	RCCD1	A6NED2	376 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	EDIL3	O43854	480 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	ENTPD3	O75355	529 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	MOCS3	O95396	460 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	CYP3A4	P08684	503 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	CCDC172	P0C7W6	258 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	CYP11B2	P19099	503 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	ARHGAP4	P98171	946 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	PPFIA1	Q13136	1202 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	CLUL1	Q15846	466 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	HPS3	Q969F9	1004 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	RUFY1	Q96T51	708 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	INTU	Q9ULD6	942 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		15.41	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516		F8W031	263 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZNF263	O14978	683 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	SRGAP2	O75044	1071 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	SREBF1	P36956	1147 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	SLC12A3	P55017	1021 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	TNNC1	P63316	161 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	KCNMA1	Q12791	1236 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	LRRC41	Q15345	812 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	NFIL3	Q16649	462 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	C8orf74	Q6P047	294 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	KCTD1	Q719H9	257 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	KCNK18	Q7Z418	384 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	CAVIN3	Q969G5	261 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	PBK	Q96KB5	322 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	STIM2	Q9P246	746 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		15.4	■□□□□ 0.06
NEDD4L-223	ENST00000588516	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06

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