RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 TUBE1Q9UJT0 475 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 EMSYQ7Z589 1322 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 NRCAMQ92823 1304 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPRSQ13332 1948 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM86B1E9PN63 330 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 LGR5O75473 907 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 DEXIO95424 95 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM86B2P0C5J1 330 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 SETQ01105 290 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 IKBKEQ14164 716 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 MBTPS1Q14703 1052 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 GPNMBQ14956 572 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 TCTN1Q2MV58 587 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 RUFY4Q6ZNE9 571 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 HERC6Q8IVU3 1022 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 CKAP2LQ8IYA6 745 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 MYOCDQ8IZQ8 938 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 ZBTB10Q96DT7 871 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 AIFM3Q96NN9 605 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 SAMM50Q9Y512 469 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 MYO9BQ13459 2157 aa12.12□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 NFASCO94856 1347 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 MEIS1O00470 390 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 CDKL5O76039 1030 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 FOSBP53539 338 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 EVCP57679 992 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 MCTP2Q6DN12 878 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAF7Q6Q0C0 670 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 RSPH3Q86UC2 560 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 TEX2Q8IWB9 1127 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 PCYT2Q99447 389 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 MTUS1Q9ULD2 1270 aa12.11□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 MICAL3Q7RTP6 2002 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 CDH23Q9H251 3354 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 CHMP2AO43633 222 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 CCNE2O96020 404 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 CXCL10P02778 98 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 GHRP10912 638 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 INSRRP14616 1297 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 HOXC8P31273 242 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 STAT5BP51692 787 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 AK2P54819 239 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM62Q0P6H9 643 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 SCRN1Q12765 414 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 PLCB4Q15147 1175 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM160B1Q5W0V3 765 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 PDXDC2PQ6P474 469 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 NIPA1Q7RTP0 329 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAJB3Q8WWF6 145 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 ARNTL2Q8WYA1 636 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 SEPT8Q92599 483 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 TPCN1Q9ULQ1 816 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 PCDHA4Q9UN74 947 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNJ14Q9UNX9 436 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 LCHNA4D1U4 455 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 M0QZ92 97 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 RFXAPO00287 272 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 EFCAB14O75071 495 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 CAND2O75155 1236 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGEF15O94989 841 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 UPP2O95045 317 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 AMHP03971 560 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP3A4P08684 503 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 ANAPC15P60006 121 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 ANKRD1Q15327 319 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 TAF2Q6P1X5 1199 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 BLIDQ8IZY5 108 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 NECAB1Q8N987 351 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 USP38Q8NB14 1042 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 TBCKQ8TEA7 893 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP1R16BQ96T49 567 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 OSBPL7Q9BZF2 842 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF302Q9NR11 478 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 SH3GLB2Q9NR46 395 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 CDY2AQ9Y6F7 541 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 SIP14410 1827 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-209ENST00000587957 EYSQ5T1H1 3165 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-209ENST00000587957 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-209ENST00000587957 RRN3P2A6NIE6 340 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-209ENST00000587957 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-209ENST00000587957 GAS7O60861 476 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-209ENST00000587957 XBP1P17861 261 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-209ENST00000587957 NEK4P51957 841 aa12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms