RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580784.5

CSNK1D-215, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSNK1D, Length 1,081 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-215ENST00000580784 SWSAP1Q6NVH7 229 aa24.18■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.18■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 ASB2Q96Q27 587 aa24.18■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 TBC1D22BQ9NU19 505 aa24.18■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.18■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.18■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 EVPLQ92817 2033 aa24.18■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 EDIL3O43854 480 aa24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC26A2P50443 739 aa24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 NLRP5P59047 1200 aa24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF302Q9NR11 478 aa24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 WDR81Q562E7 1941 aa24.17■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 XIRP2A4UGR9 3374 aa24.16■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 CPLX1O14810 134 aa24.16■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 CIITAP33076 1130 aa24.16■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 IER5Q5VY09 327 aa24.16■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.16■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.16■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 YME1L1Q96TA2 773 aa24.16■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 ENPP3O14638 875 aa24.15■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 HBP1O60381 514 aa24.15■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 ATP4AP20648 1035 aa24.15■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 KLRC1P26715 233 aa24.15■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.15■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.15■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 LENG9Q96B70 501 aa24.15■■□□□ 1.46
CSNK1D-215ENST00000580784 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.14■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 CD52P31358 61 aa24.14■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 TFF2Q03403 129 aa24.14■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 NLRC5Q86WI3 1866 aa24.14■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 AIFM3Q96NN9 605 aa24.14■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 TTC3P53804 2025 aa24.13■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 DEXIO95424 95 aa24.13■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 USP11P51784 963 aa24.13■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.13■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 FBXO22Q8NEZ5 403 aa24.13■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.13■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.13■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.13■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 M0QZ92 97 aa24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 MSH4O15457 936 aa24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 KRT76Q01546 638 aa24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 NME8Q8N427 588 aa24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 TBCKQ8TEA7 893 aa24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 SQORQ9Y6N5 450 aa24.12■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 PSAPP07602 524 aa24.11■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 EPC2Q52LR7 807 aa24.11■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.11■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 IL17RAQ96F46 866 aa24.11■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.11■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 SAMM50Q9Y512 469 aa24.11■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 COL1A2P08123 1366 aa24.11■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 BRWD1Q9NSI6 2320 aa24.1■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 NCOR1O75376 2440 aa24.1■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 SCRN1Q12765 414 aa24.1■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.1■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 BLIDQ8IZY5 108 aa24.1■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 GJA10Q969M2 543 aa24.1■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 GABBR1Q9UBS5 961 aa24.1■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 PADI3Q9ULW8 664 aa24.1■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.1■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 M0R2N6 131 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 DTNBO60941 627 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 NPY5RQ15761 445 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM192Q8IY95 271 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 SAMD11Q96NU1 681 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 MUC3AQ02505 3323 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.09■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 COL4A6Q14031 1691 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 BMP1P13497 986 aa24.08■■□□□ 1.45
CSNK1D-215ENST00000580784 KCNQ1P51787 676 aa24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms