RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 GIPC1O14908 333 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CLGNO14967 610 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 NCAM2O15394 837 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 HRO43593 1189 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PLA2G6O60733 806 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 TTLL1O95922 423 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ICAM1P05362 532 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SLC1A4P43007 532 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MAGEA9P43362 315 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 RARSP54136 660 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 NRLP54845 237 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 RPS6P62753 249 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 KRT17Q04695 432 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 NBR1Q14596 966 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 UBXN2BQ14CS0 331 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 STXBP2Q15833 593 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC6Q16204 474 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 COL28A1Q2UY09 1125 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 LETM2Q2VYF4 491 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SLC44A4Q53GD3 710 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 TNNI3KQ59H18 835 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 FBXO47Q5MNV8 452 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 FAM102BQ5T8I3 360 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 STPG1Q5TH74 334 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MYSM1Q5VVJ2 828 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 RCSD1Q6JBY9 416 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CTR9Q6PD62 1173 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 RNF207Q6ZRF8 634 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC149Q6ZUS6 474 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 KCTD1Q719H9 257 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF605Q86T29 641 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 LCORLQ8N3X6 602 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PPTC7Q8NI37 304 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 FEZF2Q8TBJ5 459 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 GLG1Q92896 1179 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CEP95Q96GE4 821 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 DDRGK1Q96HY6 314 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 NELL2Q99435 816 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 C16orf70Q9BSU1 422 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 FTHL17Q9BXU8 183 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 OSBPL6Q9BZF3 934 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ARMT1Q9H993 441 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 DZANK1Q9NVP4 752 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MTMR4Q9NYA4 1195 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PRR12Q9ULL5 1215 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 GPSM3Q9Y4H4 160 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PTPRCP08575 1304 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF532Q9HCE3 1301 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 LOC400499M0QZD8 3231 aa2.85□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ACACAQ13085 2346 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SPDYE4A6NLX3 237 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MINDY4BA8MYZ0 360 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 AXIN1O15169 862 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ARHGAP6O43182 974 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 MAP3K13O43283 966 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SORBS3O60504 671 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SEC24BO95487 1268 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PRB1P04280 392 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF806P0C7X5 589 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 SCG2P13521 617 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 EPCAMP16422 314 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 PDE6AP16499 860 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 LAG3P18627 525 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 RASA1P20936 1047 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CD72P21854 359 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 HOXC8P31273 242 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CD52P31358 61 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 CA8P35219 290 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD53-201ENST00000579969 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms