RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 IFNGR1P15260 489 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 RPL17P18621 184 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ITGAEP38570 1179 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 CRKP46108 304 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SEZ6Q53EL9 994 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 PRR31Q5SQ13 230 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 WWC2Q6AWC2 1192 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 PPP4R4Q6NUP7 873 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ETV3LQ6ZN32 361 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ERMP1Q7Z2K6 904 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 BRF1Q92994 677 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 OSBPL2Q9H1P3 480 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 TSPY26PQ9H489 355 aa3.58□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 RABL2BQ9UNT1 228 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 RWDD3Q9Y3V2 267 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 CHL1O00533 1208 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 KIF3BO15066 747 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 CAND2O75155 1236 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 CD247P20963 164 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 MCM4P33991 863 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 INHBEP58166 350 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 IL16Q14005 1332 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 PPP2R5AQ15172 486 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 AMOTQ4VCS5 1084 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC158Q5M9N0 1113 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF575Q86XF7 245 aa3.57□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 SLC26A4O43511 780 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 FHL2Q14192 279 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 TOMM20Q15388 145 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 TAX1BP1Q86VP1 789 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRM-204ENST00000577468 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 JMYQ8N9B5 988 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-204ENST00000577468 C17orf50Q8WW18 174 aa3.56□□□□□ -1.84
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