RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 BRIP1Q9BX63 1249 aa4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 PLA2G12BQ9BX93 195 aa4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 ASH2LQ9UBL3 628 aa4.55□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 KRIT1O00522 736 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 KLF4O43474 513 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 MAFKO60675 156 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 CDC14BO60729 498 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 GRIN1Q05586 938 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 FOXL1Q12952 345 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 PROSER1Q86XN7 944 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 DTX3Q8N9I9 347 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 SLC6A20Q9NP91 592 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 PARPBPQ9NWS1 579 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa4.54□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 PRODHO43272 600 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 COL6A2P12110 1019 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 CD38P28907 300 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 CTGFP29279 349 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 NTRK3Q16288 839 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 CYP4F22Q6NT55 531 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 OSBP2Q969R2 916 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 SGSM3Q96HU1 749 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 GMLQ99445 158 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 HSPBP1Q9NZL4 362 aa4.53□□□□□ -1.68
FAM227B-211ENST00000560557 BLACEA4D250 179 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 MATN2O00339 956 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 LTFP02788 710 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 GRK2P25098 689 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 GRK3P35626 688 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 LCE1EQ5T753 118 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 LBX2Q6XYB7 198 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 OTOP3Q7RTS5 596 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 TRIM48Q8IWZ4 208 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 SLC43A3Q8NBI5 491 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 DCAF4Q8WV16 495 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 KCNJ15Q99712 375 aa4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 IQCA1LA6NCM1 817 aa4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 RHOBTB3O94955 611 aa4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 FGFR1P11362 822 aa4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 TUSC3Q13454 348 aa4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 VASNQ6EMK4 673 aa4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 NSMFQ6X4W1 530 aa4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.51□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 ASXL2Q76L83 1435 aa4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 ZAR1LA6NP61 321 aa4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 CKMP06732 381 aa4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 GNAT1P11488 350 aa4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 FAHP16930 419 aa4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 SLC25A3Q00325 362 aa4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 SPIRE1Q08AE8 756 aa4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 RAB33AQ14088 237 aa4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 KIZQ2M2Z5 673 aa4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 KCND1Q9NSA2 647 aa4.5□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 FBXO21O94952 628 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 SOD2P04179 222 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 GLRBP48167 497 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 RBM25P49756 843 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 GPR85P60893 370 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 PCOLCEQ15113 449 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 SKIDA1Q1XH10 827 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 STYK1Q6J9G0 422 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 IPPKQ9H8X2 491 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 ZFP69BQ9UJL9 534 aa4.49□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 RPS6KA4O75676 772 aa4.48□□□□□ -1.69
FAM227B-211ENST00000560557 PFKPQ01813 784 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms