RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 CAMKK2Q96RR4 588 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 TRIM75PA6NK02 468 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ACOT7O00154 380 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 NFIBO00712 420 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 FOXP2O15409 715 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 CYBBP04839 570 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 CYP17A1P05093 508 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 MMEP08473 750 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 MED14OSP0DP75 135 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 RBP3P10745 1247 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 GLDCP23378 1020 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ARL4AP40617 200 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ERVFRD-1P60508 538 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 PDCD1Q15116 288 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 EPHA7Q15375 998 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM240Q5SV17 173 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 NXNQ6DKJ4 435 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 CHPFQ8IZ52 775 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ARRDC4Q8NCT1 418 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 LMBR1Q8WVP7 490 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ASB15Q8WXK1 588 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 PEX11GQ96HA9 241 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 TOX2Q96NM4 488 aa4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 PRC1O43663 620 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 PEX10O60683 326 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 RFPL1O75677 317 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 CFBP00751 764 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 KRT1P04264 644 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ATF3P18847 181 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 SDHBP21912 280 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 GPR3P46089 330 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 SCAND1P57086 179 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 HERVK_113P62684 666 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 GRIN1Q05586 938 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 PAQR3Q6TCH7 311 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 RPTNQ6XPR3 784 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 FRMD7Q6ZUT3 714 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 TRIM48Q8IWZ4 208 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 CCDC146Q8IYE0 955 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 C7orf31Q8N865 590 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 TSPAN17Q96FV3 270 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 FAXDC2Q96IV6 333 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 CCDC136Q96JN2 1154 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ORAI2Q96SN7 254 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 SLC52A1Q9NWF4 448 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 IP6K2Q9UHH9 426 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 MSRAQ9UJ68 235 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa4□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 GOLGA8AA7E2F4 631 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 GOLGA8BA8MQT2 603 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 NUDT19A8MXV4 375 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 HRKO00198 91 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 PCDHGA12O60330 932 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 SEMA7AO75326 666 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 C1QTNF9P0C862 333 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 FAHP16930 419 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 AOAHP28039 575 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 THBS2P35442 1172 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 PDE6BP35913 854 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 GNALP38405 381 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 MANFP55145 182 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 MOGSQ13724 837 aa3.99□□□□□ -1.77
TMOD3-205ENST00000558714 ODF1Q14990 250 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms