RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 SLC26A2P50443 739 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 SLC9A7Q96T83 725 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 MSRAQ9UJ68 235 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.62■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 GAS7O60861 476 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 ARHGEF15O94989 841 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 UGCGQ16739 394 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 LETM2Q2VYF4 491 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 MYLIPQ8WY64 445 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 DISC1Q9NRI5 854 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.61■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 WDR64B1ANS9 1081 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 CHMP2AO43633 222 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 ZNF862O60290 1169 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 HBP1O60381 514 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 PSAPP07602 524 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 KRT40Q6A162 431 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 NEK8Q86SG6 692 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 MMP1P03956 469 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 KRT2P35908 639 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 GBF1Q92538 1859 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 KAT6AQ92794 2004 aa23.59■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 BTBD18B2RXH4 712 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 GHRP10912 638 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 KCNJ6P48051 423 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 IKBKEQ14164 716 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 LPIN1Q14693 890 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 SAMM50Q9Y512 469 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 PTPRSQ13332 1948 aa23.58■■□□□ 1.37
CS-222ENST00000550996 MYO9BQ13459 2157 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 WNT7AO00755 349 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 CA3P07451 260 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 KLRC1P26715 233 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 RABEP1Q15276 862 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 RSPH3Q86UC2 560 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 SEPT8Q92599 483 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 VAV3Q9UKW4 847 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 COL1A2P08123 1366 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 TRANK1O15050 2925 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 LCHNA4D1U4 455 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 C22orf31O95567 290 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 JAK3P52333 1124 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 GUCY1B3Q02153 619 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 SPRED2Q7Z698 418 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 HAS1Q92839 578 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 SIP14410 1827 aa23.56■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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CS-222ENST00000550996 EFCAB14O75071 495 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 SFNP31947 248 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 PRKCEQ02156 737 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.55■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 STBD1O95210 358 aa23.54■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 GJB5O95377 273 aa23.54■■□□□ 1.36
CS-222ENST00000550996 RDM1Q8NG50 284 aa23.54■■□□□ 1.36
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