RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 CST5P28325 142 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 LBX1P52954 281 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 KARSQ15046 597 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 SPECC1Q5M775 1068 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 CCDC183Q5T5S1 534 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 RNF180Q86T96 592 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 PDILTQ8N807 584 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 RAD54LQ92698 747 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 GJA10Q969M2 543 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 DYDC2Q96IM9 177 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 NUP62CLQ9H1M0 184 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 DACT1Q9NYF0 836 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 GABBR1Q9UBS5 961 aa10.4□□□□□ -0.74
CS-220ENST00000550700 COL1A2P08123 1366 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 PP2D1A8MPX8 630 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 GAS2O43903 313 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 HBP1O60381 514 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 NR1I2O75469 434 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 MMP3P08254 477 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 PLCG1P19174 1290 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 SCP2P22307 547 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 CDC25AP30304 524 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 YWHABP31946 246 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 CYP4A11Q02928 519 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 GRB10Q13322 594 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 E2F4Q16254 413 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 HSDL1Q3SXM5 330 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 CNNM4Q6P4Q7 775 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 USP49Q70CQ1 688 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 CKAP2LQ8IYA6 745 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 TRPV1Q8NER1 839 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 GPT2Q8TD30 523 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 ATP8B4Q8TF62 1192 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 AFG1LQ8WV93 481 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 DHX58Q96C10 678 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 PNMA5Q96PV4 448 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 CLSTN2Q9H4D0 955 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 KBTBD4Q9NVX7 518 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 RMND1Q9NWS8 449 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 RGL1Q9NZL6 768 aa10.39□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 POTEB3A0JP26 581 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 ARHGEF35A5YM69 484 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 H3BRB1 525 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 DGAT1O75907 488 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 OATP04181 439 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 LGALS2P05162 132 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 PLA2G4BP0C869 781 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 GNAT1P11488 350 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 LIG1P18858 919 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 ABCD1P33897 745 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 RFC5P40937 340 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 CAP1Q01518 475 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 PRKCEQ02156 737 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 SP4Q02446 784 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 LONRF3Q496Y0 759 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 ZNF484Q5JVG2 852 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 GNASQ5JWF2 1037 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 POTEBQ6S5H4 581 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 BANK1Q8NDB2 785 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 SLC17A8Q8NDX2 589 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 MCPH1Q8NEM0 835 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 COPS5Q92905 334 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 ARMC5Q96C12 935 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 PAGE5Q96GU1 130 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 GSDMAQ96QA5 445 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 UIMC1Q96RL1 719 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 PANK2Q9BZ23 570 aa10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 ARID2Q68CP9 1835 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 POTEFA5A3E0 1075 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 RRN3P2A6NIE6 340 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 MAGEB2O15479 319 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 KRT18P05783 430 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 CDC42EP1Q00587 391 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 POSTNQ15063 836 aa10.37□□□□□ -0.75
CS-220ENST00000550700 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms