RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 MSRAQ9UJ68 235 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.07■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 FAM205CA6NFA0 338 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 WDR64B1ANS9 1081 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 GAS7O60861 476 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 CHRNA1P02708 482 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 PSAPP07602 524 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 MYOGP15173 224 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 KRT2P35908 639 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 NR5A1Q13285 461 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 LETM2Q2VYF4 491 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 NEK8Q86SG6 692 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 COL1A2P08123 1366 aa20.06■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 HBP1O60381 514 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 MMP1P03956 469 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 KCNJ6P48051 423 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 GRIN2CQ14957 1233 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 MYLIPQ8WY64 445 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.05■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 CHMP2AO43633 222 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 FOSBP53539 338 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 IKBKEQ14164 716 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 DISC1Q9NRI5 854 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 SAMM50Q9Y512 469 aa20.04■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 EYSQ5T1H1 3165 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 ZNF862O60290 1169 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 EFCAB14O75071 495 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 SFNP31947 248 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 JAK3P52333 1124 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 RABEP1Q15276 862 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 UGCGQ16739 394 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 KRT40Q6A162 431 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 RSPH3Q86UC2 560 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 ARID2Q68CP9 1835 aa20.03■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 CA3P07451 260 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 GHRP10912 638 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 LPIN1Q14693 890 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 RDM1Q8NG50 284 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 SEPT8Q92599 483 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.02■□□□□ 0.8
CS-219ENST00000550655 BTBD18B2RXH4 712 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 ARHGEF15O94989 841 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 C22orf31O95567 290 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 KLRC1P26715 233 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 PRKCEQ02156 737 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 POTEDQ86YR6 584 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 VAV3Q9UKW4 847 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 TRANK1O15050 2925 aa20.01■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 COL4A6Q14031 1691 aa20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 GJB5O95377 273 aa20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 OATP04181 439 aa20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 TMEM62Q0P6H9 643 aa20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 TRIM29Q14134 588 aa20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 MIER3Q7Z3K6 550 aa20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 HAS1Q92839 578 aa20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 APBB2Q92870 758 aa20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 FAM167AQ96KS9 214 aa20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20■□□□□ 0.79
CS-219ENST00000550655 NLRC5Q86WI3 1866 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms