RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 M0QZ92 97 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 EDIL3O43854 480 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 JAK3P52333 1124 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 TRIM29Q14134 588 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 NEK8Q86SG6 692 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 TLL1O43897 1013 aa28.23■■■□□ 2.11
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TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.23■■■□□ 2.11
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TM7SF3-212ENST00000543088 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.23■■■□□ 2.11
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TM7SF3-212ENST00000543088 MBOAT7Q96N66 472 aa28.23■■■□□ 2.11
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TM7SF3-212ENST00000543088 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
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TM7SF3-212ENST00000543088 MICAL3Q7RTP6 2002 aa28.23■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa28.22■■■□□ 2.11
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TM7SF3-212ENST00000543088 MYOGP15173 224 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 DEFB103AP81534 67 aa28.22■■■□□ 2.11
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TM7SF3-212ENST00000543088 RDM1Q8NG50 284 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 GJB4Q9NTQ9 266 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 GABBR1Q9UBS5 961 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 PTPRSQ13332 1948 aa28.22■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 CHMP2AO43633 222 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 DTNBO60941 627 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 CHRNA1P02708 482 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
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TM7SF3-212ENST00000543088 CDY2AQ9Y6F7 541 aa28.21■■■□□ 2.11
TM7SF3-212ENST00000543088 PSMD10O75832 226 aa28.2■■■□□ 2.1
TM7SF3-212ENST00000543088 GHRP10912 638 aa28.2■■■□□ 2.1
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TM7SF3-212ENST00000543088 NME8Q8N427 588 aa28.2■■■□□ 2.1
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TM7SF3-212ENST00000543088 SIP14410 1827 aa28.19■■■□□ 2.1
TM7SF3-212ENST00000543088 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.19■■■□□ 2.1
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TM7SF3-212ENST00000543088 RABEP1Q15276 862 aa28.17■■■□□ 2.1
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TM7SF3-212ENST00000543088 GJA10Q969M2 543 aa28.16■■■□□ 2.1
TM7SF3-212ENST00000543088 TBX3O15119 743 aa28.15■■■□□ 2.1
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TM7SF3-212ENST00000543088 ST3GAL1Q11201 340 aa28.15■■■□□ 2.1
TM7SF3-212ENST00000543088 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
TM7SF3-212ENST00000543088 KRT40Q6A162 431 aa28.15■■■□□ 2.1
TM7SF3-212ENST00000543088 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
TM7SF3-212ENST00000543088 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TM7SF3-212ENST00000543088 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
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