RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 FANCGO15287 622 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 Q3C1V9 767 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR24Q96S15 920 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 NDST4Q9H3R1 872 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 RGL1Q9NZL6 768 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.4■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 ASTN1O14525 1302 aa22.39■■□□□ 1.18
PACSIN3-211ENST00000539589 CHMP2AO43633 222 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF5CO60282 957 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 GAS7O60861 476 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 NR3C2P08235 984 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMC6P62333 389 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 FIGNQ5HY92 759 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.39■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBED6P86452 979 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP4A11Q02928 519 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 45.2
PACSIN3-211ENST00000539589 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR81Q562E7 1941 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PQJ5 194 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 OSBPP22059 807 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 RIT2Q99578 217 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CHP1Q99653 195 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 MAF1Q9H063 256 aa22.38■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 RASSF10A6NK89 507 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP9AO75110 1047 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CNTN2Q02246 1040 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 MTMR1Q13613 665 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 GIT2Q14161 759 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP63Q96MT8 703 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.37■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 RGS20O76081 388 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 SLITRK3O94933 977 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 NDUFA10O95299 355 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 GNA14O95837 355 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP2C8P10632 490 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CCND2P30279 289 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 KLK7P49862 253 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 MEA1Q16626 185 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 EYA4O95677 639 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 ERCC3P19447 782 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 FSTL1Q12841 308 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 DYDC2Q96IM9 177 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.36■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR59Q6PJI9 974 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 REEP2Q9BRK0 252 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO40Q9UH90 709 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 BTBD19C9JJ37 291 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CCL15Q16663 113 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 SPRYD7Q5W111 196 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 CHADLQ6NUI6 762 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 MNS1Q8NEH6 495 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
PACSIN3-211ENST00000539589 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.35■■□□□ 1.17
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