RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 MIS18AQ9NYP9 233 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.59□□□□□ -0.87
LMO3-216ENST00000537568 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.59□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 DLGAP3O95886 979 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 RASGRF1Q13972 1273 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 FXNQ16595 210 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PROSER3Q2NL68 480 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 RNF43Q68DV7 783 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 MCM10Q7L590 875 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 FAM89AQ96GI7 184 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 MAST4O15021 2626 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 ZNF292O60281 2723 aa9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 XDHP47989 1333 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 KIF16BQ96L93 1317 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 CILPO75339 1184 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 NME2P22392 152 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 KLRK1P26718 216 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PCDH1Q08174 1060 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 MTERF2Q49AM1 385 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 BEND4Q6ZU67 534 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 SULF2Q8IWU5 870 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.57□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 IL16Q14005 1332 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 APAF1O14727 1248 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 MED26O95402 600 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 ANXA1P04083 346 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 GYS2P54840 703 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 GSTM4Q03013 218 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PPATQ06203 517 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 DCTN1Q14203 1278 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 LRRC14Q15048 493 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 STK35Q8TDR2 534 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 WRNIP1Q96S55 665 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 COA1Q9GZY4 146 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa9.56□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 DDAH1O94760 285 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 GJB6O95452 261 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 IMPDH2P12268 514 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 TCF15Q12870 199 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 SQSTM1Q13501 440 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.55□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 TIAF1O95411 115 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 SGO2Q562F6 1265 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 COA7Q96BR5 231 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 TMEM260Q9NX78 707 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 PLXNB2O15031 1838 aa9.54□□□□□ -0.88
LMO3-216ENST00000537568 B2RBV5 119 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms