RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.78□□□□□ -0.52
LMO3-215ENST00000537304 ECT2Q9H8V3 914 aa11.78□□□□□ -0.52
LMO3-215ENST00000537304 KIF9Q9HAQ2 790 aa11.78□□□□□ -0.52
LMO3-215ENST00000537304 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
LMO3-215ENST00000537304 KCNMB3Q9NPA1 279 aa11.78□□□□□ -0.52
LMO3-215ENST00000537304 ZFATQ9P243 1243 aa11.78□□□□□ -0.52
LMO3-215ENST00000537304 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.78□□□□□ -0.52
LMO3-215ENST00000537304 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.78□□□□□ -0.52
LMO3-215ENST00000537304 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.78□□□□□ -0.52
LMO3-215ENST00000537304 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
LMO3-215ENST00000537304 KIF13BQ9NQT8 1826 aa11.77□□□□□ -0.52
LMO3-215ENST00000537304 LRRD1A4D1F6 860 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 A6NHS1 94 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PP2D1A8MPX8 630 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 SNX3O60493 162 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DIAPH2O60879 1101 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 HIP1RO75146 1068 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 GNA11P29992 359 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DNA2P51530 1060 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PTENP60484 403 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CCDC15Q0P6D6 951 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 GALNTL6Q49A17 601 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DGKHQ86XP1 1220 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 SH3TC2Q8TF17 1288 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 C6orf50Q9HD87 102 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 BARHL2Q9NY43 387 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PNMA2Q9UL42 364 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.77□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 A0A087X0T9 212 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 POTEFA5A3E0 1075 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TLR2O60603 784 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 H2AFZP0C0S5 128 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 FAM228BP0C875 321 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 POTEIP0CG38 1075 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 POTEJP0CG39 1038 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 NCALDP61601 193 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 KCNMA1Q12791 1236 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 BNIP1Q12981 228 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 GRM4Q14833 912 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 INF2Q27J81 1249 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 H2AFVQ71UI9 128 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 NEK8Q86SG6 692 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 METTL13Q8N6R0 699 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ZFAND2BQ8WV99 257 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ZNF570Q96NI8 536 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 RXFP1Q9HBX9 757 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TXLNGQ9NUQ3 528 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 AMFRQ9UKV5 643 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 FAM205AQ6ZU69 1335 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 LAMB1P07942 1786 aa11.76□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PODXLO00592 558 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TOM1O60784 492 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CAND2O75155 1236 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 NOL4O94818 638 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 RARAP10276 462 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CNGA1P29973 690 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PRKCIP41743 596 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 MSH2P43246 934 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DR1Q01658 176 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TAF11Q15544 211 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TRADDQ15628 312 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 SBK1Q52WX2 424 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 MFSD5Q6N075 450 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TMC4Q7Z404 712 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TRIM59Q8IWR1 403 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 RNF217Q8TC41 542 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DYDC1Q8WWB3 177 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 PLIN2Q99541 437 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 TSC22D3Q99576 134 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 ERP44Q9BS26 406 aa11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
LMO3-215ENST00000537304 NEUROG2Q9H2A3 272 aa11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms