RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531895.5

ANKRD42-208, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-208ENST00000531895 ZBED6P86452 979 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD42-208ENST00000531895 FKBP15Q5T1M5 1219 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD42-208ENST00000531895 ARHGEF16Q5VV41 709 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD42-208ENST00000531895 VSIG10LQ86VR7 867 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD42-208ENST00000531895 RETREG2Q8NC44 543 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD42-208ENST00000531895 LZTFL1Q9NQ48 299 aa17.08■□□□□ 0.33
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
ANKRD42-208ENST00000531895 A0A1W2PQJ5 194 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GCNT3O95395 438 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TUBB4AP04350 444 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 APBA1Q02410 837 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 C9orf131Q5VYM1 1079 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SH2D3AQ9BRG2 576 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PDXKO00764 312 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TBCAO75347 108 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NOL4O94818 638 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 P4HBP07237 508 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NR3C2P08235 984 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NR2F2P24468 414 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GNG11P61952 73 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 CCDC40Q4G0X9 1142 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 MOB2Q70IA6 237 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 MYCT1Q8N699 235 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 BAP1Q92560 729 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 CYP39A1Q9NYL5 469 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TFR2Q9UP52 801 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 LOC285556D6RIA3 1793 aa17.07■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 FAM13AO94988 1023 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 KIF20AO95235 890 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NDUFA10O95299 355 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 CASP4P49662 377 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 HERVK_113P62684 666 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 FSTL1Q12841 308 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF720Q7Z2F6 126 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 MMRN2Q9H8L6 949 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PNMA2Q9UL42 364 aa17.06■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 CLIC2O15247 247 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 AKAP3O75969 853 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GAP43P17677 238 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GUCY2CP25092 1073 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GPIHBP1Q8IV16 184 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NEK9Q8TD19 979 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 STRA6Q9BX79 667 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TEX13BQ9BXU2 312 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PARVGQ9HBI0 331 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TBC1D22BQ9NU19 505 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 CETN3O15182 167 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 HIP1RO75146 1068 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 LYPLA2O95372 231 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 RARRES1P49788 294 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PADI6Q6TGC4 694 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 BTBD7Q9P203 1132 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 TRIM10Q9UDY6 481 aa17.05■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ARHGEF35A5YM69 484 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ZNF263O14978 683 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 GNA14O95837 355 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NR3C1P04150 777 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 QARSP47897 775 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PLS1Q14651 629 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 MAEAQ7L5Y9 396 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 BORCS6Q96GS4 357 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 HOXC10Q9NYD6 342 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ODF2LQ9ULJ1 636 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SAMM50Q9Y512 469 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 V9GYY5 206 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 DOCK5Q9H7D0 1870 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 RCCD1A6NED2 376 aa17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 PPP1R37O75864 691 aa17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 KCNA2P16389 499 aa17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 CCND2P30279 289 aa17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 KCNH2Q12809 1159 aa17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 SULF1Q8IWU6 871 aa17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ANKRD7Q92527 254 aa17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ACAD9Q9H845 621 aa17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 KCND2Q9NZV8 630 aa17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42-208ENST00000531895 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms