RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530005.5

SLC43A3-217, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC43A3, Length 1,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-217ENST00000530005 HBP1O60381 514 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 GAS7O60861 476 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 CHRNA1P02708 482 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 PSAPP07602 524 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 CTSHP09668 335 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 IGBP1P78318 339 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 MGAT3Q09327 533 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 GUCD1Q96NT3 240 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 DISC1Q9NRI5 854 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 IL27Q8NEV9 243 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM161BQ96MY7 647 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.87■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF862O60290 1169 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 FOSBP53539 338 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 RABGGTBP53611 331 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 TIFAQ96CG3 184 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 EYSQ5T1H1 3165 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 SFNP31947 248 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 WDR5P61964 334 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 UGCGQ16739 394 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 RDM1Q8NG50 284 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 HAS1Q92839 578 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 SLC9A7Q96T83 725 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 SAMM50Q9Y512 469 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 COL1A2P08123 1366 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 MICAL3Q7RTP6 2002 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 WNT7AO00755 349 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 CHMP2AO43633 222 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 ST18O60284 1047 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 JAK3P52333 1124 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 TRIM29Q14134 588 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 RAB30Q15771 203 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM20AQ96MK3 541 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 VAV3Q9UKW4 847 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 MYOGP15173 224 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 KLRC1P26715 233 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 DEFB103AP81534 67 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 GUCY1B3Q02153 619 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 RSPH3Q86UC2 560 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 C8orf76Q96K31 380 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 BACH2Q9BYV9 841 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF576Q9H609 170 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC43A3-217ENST00000530005 TBX3O15119 743 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 PPP2R5CQ13362 524 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 IKBKEQ14164 716 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 POTEDQ86YR6 584 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 TMX3Q96JJ7 454 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 MSRAQ9UJ68 235 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 EVPLQ92817 2033 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 EML1O00423 815 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 EFCAB14O75071 495 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 STBD1O95210 358 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 C22orf31O95567 290 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 SEPT8Q92599 483 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 MYO9BQ13459 2157 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 OATP04181 439 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 GHRP10912 638 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 KCNJ6P48051 423 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 PRKCEQ02156 737 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 LPIN1Q14693 890 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 GRIN2CQ14957 1233 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC43A3-217ENST00000530005 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 28.7
SLC43A3-217ENST00000530005 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms