RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 MBD3O95983 291 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 LIG1P18858 919 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP4AP20648 1035 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 BEX3Q00994 111 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 XKR3Q5GH77 459 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 PDILTQ8N807 584 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 OGDHLQ9ULD0 1010 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 DNM3Q9UQ16 869 aa24.61■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 STBD1O95210 358 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 GJB1P08034 283 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC41Q15345 812 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 NFKBIBQ15653 356 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM50Q86XT4 487 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM167AQ96KS9 214 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 DEFB118Q96PH6 123 aa24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 H3BRB1 525 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF202O95125 648 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 CAPN2P17655 700 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 STAT6P42226 847 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 PRKCEQ02156 737 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNK18Q7Z418 384 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 LRRC15Q8TF66 581 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 PANK2Q9BZ23 570 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 NR1I2O75469 434 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 SLFN14P0C7P3 912 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF286BP0CG31 522 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 GPT2Q8TD30 523 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 KAT2BQ92831 832 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 TIGD1Q96MW7 591 aa24.59■■□□□ 1.53
PACSIN3-205ENST00000528462 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 HAS3O00219 553 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 EYA4O95677 639 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 OATP04181 439 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMC6P62333 389 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNA10Q16322 511 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 ANO5Q75V66 913 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 DHX58Q96C10 678 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 PLIN2Q99541 437 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 NRBP2Q9NSY0 501 aa24.58■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 CABYRO75952 493 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 PLCB4Q15147 1175 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 LONRF3Q496Y0 759 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 RAD54LQ92698 747 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 DACT1Q9NYF0 836 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 PPME1Q9Y570 386 aa24.57■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 E9PMD0 336 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 SGPL1O95470 568 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 ASGR1P07306 291 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 MYL3P08590 195 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.56■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 DNM1LO00429 736 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBTB39O15060 712 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 HBP1O60381 514 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 KINO60870 393 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 RARRES1P49788 294 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 KRBA2Q6ZNG9 492 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.55■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 GJA8P48165 433 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 ACLYP53396 1101 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC12A3P55017 1021 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 KANK3Q6NY19 840 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 CEP57L1Q8IYX8 460 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 BHMT2Q9H2M3 363 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 TNMDQ9H2S6 317 aa24.54■■□□□ 1.52
PACSIN3-205ENST00000528462 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms