RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 TCTN1Q2MV58 587 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 C8orf34Q49A92 452 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 IER5Q5VY09 327 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 RDM1Q8NG50 284 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.86■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 MYO9BQ13459 2157 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 GAS7O60861 476 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 CA3P07451 260 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 JAK3P52333 1124 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 DEFB103AP81534 67 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 USP38Q8NB14 1042 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM167AQ96KS9 214 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 RAD9AQ99638 391 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 GBF1Q92538 1859 aa20.85■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 M0QZ92 97 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 LARGE1O95461 756 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 NECAB1Q8N987 351 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 IL27Q8NEV9 243 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 DISC1Q9NRI5 854 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 SAMM50Q9Y512 469 aa20.84■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 PSMD10O75832 226 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 TDP2O95551 362 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 ATP4AP20648 1035 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 INF2Q27J81 1249 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 NEK8Q86SG6 692 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.83■□□□□ 0.93
TSPAN4-216ENST00000526055 KLRC1P26715 233 aa20.82■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 TAP1Q03518 808 aa20.82■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 LPIN1Q14693 890 aa20.82■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.82■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.82■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.82■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 UIMC1Q96RL1 719 aa20.82■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 INSL6Q9Y581 213 aa20.82■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.82■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.82■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 GHRP10912 638 aa20.81■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 KRT2P35908 639 aa20.81■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 LETM2Q2VYF4 491 aa20.81■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.81■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.81■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.81■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 TOP1MTQ969P6 601 aa20.81■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM20AQ96MK3 541 aa20.81■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.81■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 DLL1O00548 723 aa20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 TBX3O15119 743 aa20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 MAGEB2O15479 319 aa20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIM29Q14134 588 aa20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.8■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 PTPRSQ13332 1948 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 CHD9Q3L8U1 2897 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 C22orf31O95567 290 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 OATP04181 439 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRE1Q14246 886 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 MIER3Q7Z3K6 550 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 OXER1Q8TDS5 423 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF2CQ99661 725 aa20.79■□□□□ 0.92
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 561.9 ms