RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517728.1

IGHVII-44-2-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-44-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-44-2, Length 250 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 B4GALT4O60513 344 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CDKL5O76039 1030 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SCG2P13521 617 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CPA1P15085 419 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IFNAR1P17181 557 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GNA11P29992 359 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ADD1P35611 737 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CHMP4BP1P59074 171 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRR20EP86478 221 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRR20CP86479 221 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRR20DP86480 221 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRR20BP86481 221 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRR20AP86496 221 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MTMR1Q13613 665 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ANKRD1Q15327 319 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SHHQ15465 462 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 UBE2SQ16763 222 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CAGE1Q8TC20 777 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 BICD2Q8TD16 824 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF592Q92610 1267 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRPV6Q9H1D0 765 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C6orf50Q9HD87 102 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IL23AQ9NPF7 189 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PDRG1Q9NUG6 133 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMCHD1A6NHR9 2005 aa5.89□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HAS3O00219 553 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ADH1CP00326 375 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FGBP02675 491 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF286BP0CG31 522 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GNAT1P11488 350 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ACTN1P12814 892 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CSF2RAP15509 400 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ITGB8P26012 769 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CDC27P30260 824 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CYP2C18P33260 490 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SOX11P35716 441 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF76P36508 570 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SREBF1P36956 1147 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PTK7Q13308 1070 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PTGISQ16647 500 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HSDL1Q3SXM5 330 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C9orf50Q5SZB4 431 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NIPA1Q7RTP0 329 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 AFAP1L1Q8TED9 768 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KAT2BQ92831 832 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GLMNQ92990 594 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SDF4Q9BRK5 362 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ALG1Q9BT22 464 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SLC26A6Q9BXS9 759 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ANO3Q9BYT9 981 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 JADE2Q9NQC1 790 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SH3GLB2Q9NR46 395 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TOR4AQ9NXH8 423 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.88□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C17orf102A2RUQ5 167 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 H3BRB1 525 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CAND2O75155 1236 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DEXIO95424 95 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LGALS2P05162 132 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CYP2C9P11712 490 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SELPP16109 830 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KCNA2P16389 499 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 XBP1P17861 261 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ITGB5P18084 799 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GRM5P41594 1212 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 EPHB4P54760 987 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CCL23P55773 120 aa5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SETQ01105 290 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SP2Q02086 613 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms