RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.19■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 GPC2Q8N158 579 aa25.19■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 BANK1Q8NDB2 785 aa25.19■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 REPS2Q8NFH8 660 aa25.19■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 UBE4BO95155 1302 aa25.19■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 MTMR1Q13613 665 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 PDXDC1Q6P996 788 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 MYCT1Q8N699 235 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 KLRG1Q96E93 195 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 WNK4Q96J92 1243 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 CEP72Q9P209 647 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 CTAGE9A4FU28 777 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 LRRC53A6NM62 1247 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 SFI1A8K8P3 1242 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 EFCAB8A8MWE9 144 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 C19orf81C9J6K1 198 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 GUCY2CP25092 1073 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 POLD4Q9HCU8 107 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 PXMP2Q9NR77 195 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 RNF146Q9NTX7 359 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.18■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 NR3C1P04150 777 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 OAZ1P54368 228 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 TUBB2AQ13885 445 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 RRAGAQ7L523 313 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 FIZ1Q96SL8 496 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 FZD1Q9UP38 647 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 P4HBP07237 508 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 HMGCS2P54868 508 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC42Q96M95 316 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 RMDN3Q96TC7 470 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.16■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 NOL4O94818 638 aa25.16■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 DSG3P32926 999 aa25.16■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 NFIL3Q16649 462 aa25.16■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.16■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 KIAA1328Q86T90 577 aa25.16■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.16■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 LMNB1P20700 586 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 NMT1P30419 496 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 KCNH2Q12809 1159 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 NSMFQ6X4W1 530 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 UBXN4Q92575 508 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 RIPK3Q9Y572 518 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 TGFB1I1O43294 461 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 KCNA1Q09470 495 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC122Q5T0U0 273 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 CDC23Q9UJX2 597 aa25.15■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 AKAP3O75969 853 aa25.14■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 LYPLA2O95372 231 aa25.14■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 LCA5LO95447 670 aa25.14■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.14■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF720Q7Z2F6 126 aa25.14■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 KRT86O43790 486 aa25.14■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 EPS15P42566 896 aa25.14■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 MAPK7Q13164 816 aa25.14■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.14■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 EHBP1Q8NDI1 1231 aa25.14■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF263O14978 683 aa25.13■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 VAV2P52735 878 aa25.13■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.13■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 RCCD1A6NED2 376 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 ATP2A1O14983 1001 aa25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PDE4D-223ENST00000515011 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
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