RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-208ENST00000512193 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
NEK1-208ENST00000512193 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.71□□□□□ -1.01
NEK1-208ENST00000512193 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.71□□□□□ -1.01
NEK1-208ENST00000512193 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.71□□□□□ -1.01
NEK1-208ENST00000512193 SNX12Q9UMY4 172 aa8.71□□□□□ -1.01
NEK1-208ENST00000512193 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 F5H6K3 240 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 TRIM49P0CI25 452 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 TRIM49CP0CI26 452 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 KLRC3Q07444 240 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 NCAPHQ15003 741 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 KLHL29Q96CT2 875 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 MS4A14Q96JA4 679 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 HPSEQ9Y251 543 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 SGK1O00141 431 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 STAM2O75886 525 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 RHOBTB3O94955 611 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 HSPA6P17066 643 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 CRKP46108 304 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 KLK7P49862 253 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 SESN3P58005 492 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 DYNLT1P63172 113 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 AP3B2Q13367 1082 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 SNCBQ16143 134 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 CCDC38Q502W7 563 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.71□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 MYMKA6NI61 221 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 NDC80O14777 642 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 CAMTA2O94983 1202 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 MMP10P09238 476 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 MAN1A1P33908 653 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 PHBP35232 272 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 MAGEA9P43362 315 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 KRT81Q14533 505 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 PDXDC1Q6P996 788 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 H0YCG3 227 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 TNNC2P02585 160 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 CYP2C19P33261 490 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 GPSM2P81274 684 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 TMED2Q15363 201 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 MTERF2Q49AM1 385 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 TADA2BQ86TJ2 420 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 GDAP1Q8TB36 358 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 DYDC2Q96IM9 177 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 MXD3Q9BW11 206 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 RGL1Q9NZL6 768 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 BCS1LQ9Y276 419 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 H7C0C1 242 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 ZBTB22O15209 634 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 ATP5OP48047 213 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 IGBP1P78318 339 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 IL9RQ01113 521 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 NFIXQ14938 502 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 PSMD6Q15008 389 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 GEN1Q17RS7 908 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 ARHGAP24Q8N264 748 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 BBOF1Q8ND07 529 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 BANK1Q8NDB2 785 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 MAP3K14Q99558 947 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 TXNDC9O14530 226 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 CD58P19256 250 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 NTRK3Q16288 839 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 FAM20AQ96MK3 541 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NEK1-208ENST00000512193 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms