RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 SURF1Q15526 300 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-217ENST00000509355 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-217ENST00000509355 CD276Q5ZPR3 534 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-217ENST00000509355 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-217ENST00000509355 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-217ENST00000509355 EXOC2Q96KP1 924 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-217ENST00000509355 C8orf49Q96NF6 230 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-217ENST00000509355 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-217ENST00000509355 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-217ENST00000509355 ATP2B1P20020 1258 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-217ENST00000509355 NUDT11Q96G61 164 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-217ENST00000509355 NUB1Q9Y5A7 615 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-217ENST00000509355 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-217ENST00000509355 AMY2BP19961 511 aa7.1□□□□□ -1.27
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PDE4D-217ENST00000509355 JMYQ8N9B5 988 aa7.1□□□□□ -1.27
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PDE4D-217ENST00000509355 MAN2B1O00754 1011 aa7.07□□□□□ -1.28
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PDE4D-217ENST00000509355 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-217ENST00000509355 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-217ENST00000509355 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.07□□□□□ -1.28
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PDE4D-217ENST00000509355 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4D-217ENST00000509355 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4D-217ENST00000509355 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
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