RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 HIP1RO75146 1068 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 CHGBP05060 677 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 HERVK_113P62684 666 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 HOMER1Q86YM7 354 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 INCENPQ9NQS7 918 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 IL13RA1P78552 427 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 TCEA2Q15560 299 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 TKFCQ3LXA3 575 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 Q6ZUG5 572 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 ASB15Q8WXK1 588 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 APPBP2Q92624 585 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 DLG3Q92796 817 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 BOCQ9BWV1 1114 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.84□□□□□ -1.31
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF536O15090 1300 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 FOXP2O15409 715 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 RFPL3O75679 317 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 MPIG6BO95866 241 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 PLATP00750 562 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 JMJD7P0C870 316 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CHST14Q8NCH0 376 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 HIPK4Q8NE63 616 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 GBP4Q96PP9 640 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 GALNT8Q9NY28 637 aa6.83□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 B4GALT4O60513 344 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 SDHAP31040 664 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CSF2RBP32927 897 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 ADCY8P40145 1251 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 AMNQ9BXJ7 453 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CABP5Q9NP86 173 aa6.82□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 K7ESM1 405 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 TRAF5O00463 557 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 LAMTOR5O43504 91 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CDC45O75419 566 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 KIF11P52732 1056 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 AJUBAQ96IF1 538 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 KATNBL1Q9H079 304 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 ASB1Q9Y576 335 aa6.81□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 DVL2O14641 736 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 ITGB3P05106 788 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 POLD1P28340 1107 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 FLT3P36888 993 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 ECE1P42892 770 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CFAP100Q494V2 611 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 WNK4Q96J92 1243 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 BTBD2Q9BX70 525 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.8□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CBX4O00257 560 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 KPNA6O60684 536 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 RRADP55042 308 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CD83Q01151 205 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 STILQ15468 1287 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 SURF1Q15526 300 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 PTPN18Q99952 460 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 OR10A5Q9H207 317 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 JADE2Q9NQC1 790 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.79□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 H7C1D1 291 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 CUTAO60888 179 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 KCNQ1P51787 676 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-215ENST00000506510 PPP2CBP62714 309 aa6.78□□□□□ -1.32
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