RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 BTBD7Q9P203 1132 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 NUAK1O60285 661 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 ZEB2O60315 1214 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 PTGS1P23219 599 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 FNTBP49356 437 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 CAP1Q01518 475 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 PHF19Q5T6S3 580 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 PASD1Q8IV76 773 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 HIPK4Q8NE63 616 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 WRNIP1Q96S55 665 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 IFT22Q9H7X7 185 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 TOMM22Q9NS69 142 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 ASB1Q9Y576 335 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-215ENST00000498284 NEMP1O14524 444 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 CPEP16870 476 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 MC4RP32245 332 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 GLRBP48167 497 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 RTP5Q14D33 572 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 VWA3BQ502W6 1294 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 C11orf74Q86VG3 221 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 SCYL1Q96KG9 808 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 C16orf92Q96LL3 132 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 EMC7Q9NPA0 242 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 CROTQ9UKG9 612 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 DBX1A6NMT0 343 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 FFAR3O14843 346 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 TGM5O43548 720 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 BRINP1O60477 761 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 EYA4O95677 639 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 MPIG6BO95866 241 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ID4P47928 161 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 EPHA7Q15375 998 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 TOX2Q96NM4 488 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 INCENPQ9NQS7 918 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 GALNT8Q9NY28 637 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 SH3D21A4FU49 640 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 CYP7B1O75881 506 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 FBXO21O94952 628 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 IL18BPO95998 194 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 CFPP27918 469 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 AMPD3Q01432 767 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 STAT4Q14765 748 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 PRR31Q5SQ13 230 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 NME9Q86XW9 330 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 STPG3Q8N7X2 389 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ATL2Q8NHH9 583 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 E2F7Q96AV8 911 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 AMNQ9BXJ7 453 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ZMAT4Q9H898 229 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 NTMQ9P121 344 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 IL13P35225 146 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 LRRC32Q14392 662 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 PTPROQ16827 1216 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 VMACQ2NL98 169 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 SLC5A5Q92911 643 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 KCND1Q9NSA2 647 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 MCM8Q9UJA3 840 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1B0GTL3 188 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRK-215ENST00000498284 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms