RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496775.5

NOP56-218, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 729 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-218ENST00000496775 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 KANK3Q6NY19 840 aa14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 TOX2Q96NM4 488 aa14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 LXNQ9BS40 222 aa14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CSRNP2Q9H175 543 aa14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 TRPC6Q9Y210 931 aa14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.64□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 A0A1W2PQY0 241 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 POTEMA6NI47 508 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 MYL1P05976 194 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SCP2P22307 547 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 BEX3Q00994 111 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 RSPH3Q86UC2 560 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 NME8Q8N427 588 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.63□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 ARVCFO00192 962 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 EML1O00423 815 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CAND2O75155 1236 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 DGAT1O75907 488 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 ABCD1P33897 745 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 UBE2HP62256 183 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 PRKCEQ02156 737 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 DYDC2Q96IM9 177 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 NOD1Q9Y239 953 aa14.62□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 EYA4O95677 639 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 COL6A1P12109 1028 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 PPFIA1Q13136 1202 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 PLCB4Q15147 1175 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 IL17AQ16552 155 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 RESP18Q5W5W9 173 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 TCP11Q8WWU5 503 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CEP170P1Q96L14 293 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.61□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 ASAP2O43150 1006 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SORBS3O60504 671 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 STAT6P42226 847 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CYP4A11Q02928 519 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 BANK1Q8NDB2 785 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 KAT2BQ92831 832 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 GJA10Q969M2 543 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 PCYT2Q99447 389 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 RGL1Q9NZL6 768 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.6□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 POTEFA5A3E0 1075 aa14.59□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 MYADML2A6NDP7 307 aa14.59□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 ZNF286BP0CG31 522 aa14.59□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.59□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.59□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 INSRRP14616 1297 aa14.59□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 PTK7Q13308 1070 aa14.59□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 BFSP2Q13515 415 aa14.59□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 SNX17Q15036 470 aa14.59□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 GRIK4Q16099 956 aa14.59□□□□□ -0.07
NOP56-218ENST00000496775 XKR9Q5GH70 373 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms