RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 NEK3P51956 506 aa9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 SOGA3Q5TF21 947 aa9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF333Q96JL9 665 aa9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 PHF12Q96QT6 1004 aa9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 COPRSQ9NQ92 184 aa9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 SWAP70Q9UH65 585 aa9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM59LQ9UK28 342 aa9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 UTYO14607 1347 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ARID5AQ03989 594 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 SPAG1Q07617 926 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 MPP2Q14168 576 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 GCKRQ14397 625 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 TNIP1Q15025 636 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 VPS72Q15906 364 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 KCNN1Q92952 543 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 KANSL2Q9H9L4 492 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 MYH4Q9Y623 1939 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 CEP104O60308 925 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 PFDN1O60925 122 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 OR6B1O95007 311 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 PSMC4P43686 418 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 DNM2P50570 870 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 RASA3Q14644 834 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 PDIA6Q15084 440 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 CNGA2Q16280 664 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 MUM1Q2TAK8 710 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 TTI2Q6NXR4 508 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 NOX5Q96PH1 765 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 CARD9Q9H257 536 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 H7C1D1 291 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 TLR2O60603 784 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ACADSP16219 412 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 RTP1P59025 263 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 PTGDRQ13258 359 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 SLC29A2Q14542 456 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 RASIP1Q5U651 963 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 DTX3LQ8TDB6 740 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 FBF1Q8TES7 1133 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 CENPTQ96BT3 561 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 GPAA1O43292 621 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 CBX6O95503 412 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 CYP11B2P19099 503 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 HGSNATQ68CP4 663 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 RFX8Q6ZV50 586 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 DYDC1Q8WWB3 177 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 PTPRN2Q92932 1015 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 LRRC45Q96CN5 670 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
VWA3B-220ENST00000495571 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms