RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495491.5

HCLS1-211, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,219 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-211ENST00000495491 MARK3P27448 753 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 BMPR1AP36894 532 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.62□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 POTEB3A0JP26 581 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 GNA11P29992 359 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 GPM6BQ13491 265 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 NTRK3Q16288 839 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 PKN1Q16512 942 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 POTEBQ6S5H4 581 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 FIBCD1Q8N539 461 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 BANK1Q8NDB2 785 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 P2RX5Q93086 422 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.61□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 UPP2O95045 317 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 C6orf50Q9HD87 102 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 TRPC6Q9Y210 931 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.6□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 M0QZ92 97 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 REC8O95072 547 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 IFNAR1P17181 557 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 COL9A1P20849 921 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 RPS6KB1P23443 525 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 PSMA5P28066 241 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 FAM178BQ8IXR5 827 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 BICD2Q8TD16 824 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 PGBD1Q96JS3 809 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 TMEM260Q9NX78 707 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 PADI3Q9ULW8 664 aa14.59□□□□□ -0.07
HCLS1-211ENST00000495491 MMP1P03956 469 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 STAG3L1P0CL83 205 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 KLRC1P26715 233 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 CD52P31358 61 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 ZNF76P36508 570 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 USP11P51784 963 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 KRT76Q01546 638 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 ODR4Q5SWX8 454 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 Q6ZUG5 572 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 SKAP1Q86WV1 359 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 BRF1Q92994 677 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 LENG9Q96B70 501 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 GPR37L1O60883 481 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 ATP4AP20648 1035 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 KCNA5P22460 613 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 IGBP1P78318 339 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 FAM189BP81408 668 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 FGD1P98174 961 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 APOBRQ0VD83 1088 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 PAK2Q13177 524 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.57□□□□□ -0.08
HCLS1-211ENST00000495491 RIT2Q99578 217 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms