RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 GRIK4Q16099 956 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 PRO3102Q9H379 93 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TRPC6Q9Y210 931 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 NOD1Q9Y239 953 aa9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 POTEB3A0JP26 581 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TIE1P35590 1138 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TXKP42681 527 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 SLC26A2P50443 739 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 EPHB4P54760 987 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 PTK7Q13308 1070 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 MFSD5Q6N075 450 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 POTEHQ6S545 545 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 POTEBQ6S5H4 581 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 FERMT3Q86UX7 667 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 BANK1Q8NDB2 785 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 RDM1Q8NG50 284 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 SCLYQ96I15 445 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 MFRPQ9BY79 579 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 MTMR6Q9Y217 621 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 NRCAMQ92823 1304 aa9.74□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TMEM150BA6NC51 233 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 POTEMA6NI47 508 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 HBP1O60381 514 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 STBD1O95210 358 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 OATP04181 439 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 OR52Z1P0C646 297 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 IQCF3P0C7M6 154 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 GNAT1P11488 350 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 CKBP12277 381 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 CSF2RAP15509 400 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 PDCP20941 246 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 BMP8BP34820 402 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TECP42680 631 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 PRKCEQ02156 737 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 FPGSQ05932 587 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 RBL2Q08999 1139 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 RESTQ13127 1097 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 EPHA7Q15375 998 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 SERINC5Q86VE9 423 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 CAGE1Q8TC20 777 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 VWCEQ96DN2 955 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TUBE1Q9UJT0 475 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 PCDHA12Q9UN75 941 aa9.73□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 RRN3P2A6NIE6 340 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 STX6O43752 255 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 ACRP10323 421 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 THPOP40225 353 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 PTGDRQ13258 359 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 BFSP2Q13515 415 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 GPNMBQ14956 572 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 IL17AQ16552 155 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 BRAPQ7Z569 592 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TMEM199Q8N511 208 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 RETREG2Q8NC44 543 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 DYDC2Q96IM9 177 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 RGL1Q9NZL6 768 aa9.72□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.71□□□□□ -0.85
PKP4-216ENST00000495123 SLITRK3O94933 977 aa9.71□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 CTSHP09668 335 aa9.71□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 SELPP16109 830 aa9.71□□□□□ -0.86
PKP4-216ENST00000495123 KLRC1P26715 233 aa9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms