RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 AK2P54819 239 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF484Q5JVG2 852 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 WASF1Q92558 559 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR64B1ANS9 1081 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 Q4G0T1 1027 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 MTHFD1LQ6UB35 978 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 MOXD1Q6UVY6 613 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 TOP1MTQ969P6 601 aa26.79■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 MSH4O15457 936 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 EDIL3O43854 480 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 LPIN1Q14693 890 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 NPY5RQ15761 445 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 CDY2AQ9Y6F7 541 aa26.78■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 DLL1O00548 723 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 GHRP10912 638 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 KLRC1P26715 233 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 SFNP31947 248 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.882e-6■■■■□ 23.2
CTDSP1-211ENST00000492545 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 ARNTL2Q8WYA1 636 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC5A5Q92911 643 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 AIFM3Q96NN9 605 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 OSBPL7Q9BZF2 842 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 SAMM50Q9Y512 469 aa26.77■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 LCHNA4D1U4 455 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 GAS7O60861 476 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 NEK4P51957 841 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 RDM1Q8NG50 284 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM167AQ96KS9 214 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 UIMC1Q96RL1 719 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 DISC1Q9NRI5 854 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 TRPV2Q9Y5S1 764 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 TRANK1O15050 2925 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 CUL9Q8IWT3 2517 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGEF15O94989 841 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP4AP20648 1035 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 JAK3P52333 1124 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ERVK-21P61565 698 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM117BQ6P1L5 589 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 MBOAT7Q96N66 472 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 TEKT3Q9BXF9 490 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 FTHL17Q9BXU8 183 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 CERS4Q9HA82 394 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 LMCD1Q9NZU5 365 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 GABBR1Q9UBS5 961 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 LINC01553A4QN01 128 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 CTDNEP1O95476 244 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 GTF3C6Q969F1 213 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB10Q96DT7 871 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 YME1L1Q96TA2 773 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 NRBP2Q9NSY0 501 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 MTCH2Q9Y6C9 303 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB42B2RXF5 422 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGEB2O15479 319 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 PSMD10O75832 226 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ME3Q16798 604 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 PPM1EQ8WY54 764 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 SAMD11Q96NU1 681 aa26.72■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 EPOPA6NHQ4 379 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 RFXAPO00287 272 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ENPP3O14638 875 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 SEC24BO95487 1268 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 TDP2O95551 362 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ODR4Q5SWX8 454 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 PTPRSQ13332 1948 aa26.71■■□□□ 1.87
CTDSP1-211ENST00000492545 UPP2O95045 317 aa26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms