RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 A0A087X1B8 175 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 BLACEA4D250 179 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 UNCXA6NJT0 531 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 KCNQ1P51787 676 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 TUBA3CQ13748 450 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 GPR19Q15760 415 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 USP30Q70CQ3 517 aa6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ADH4P08319 380 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 PTGS1P23219 599 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 GJA4P35212 333 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 HHEXQ03014 270 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ARID5AQ03989 594 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 FOXL1Q12952 345 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 PAK1Q13153 545 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 TBR1Q16650 682 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF575Q86XF7 245 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 INCENPQ9NQS7 918 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 GALNT8Q9NY28 637 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.86□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 IL13RA1P78552 427 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 CFHR4Q92496 578 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 NELFAQ9H3P2 528 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 TLR9Q9NR96 1032 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.85□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ASXL2Q76L83 1435 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 MAKP20794 623 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ADCY8P40145 1251 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 STILQ15468 1287 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 FIGNQ5HY92 759 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 WDR48Q8TAF3 677 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 WNK4Q96J92 1243 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 OR10A2Q9H208 303 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ITGA4-211ENST00000490435 MAN2B1O00754 1011 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 AQP7O14520 342 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 WNT9AO14904 365 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 AOAHP28039 575 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 MEOX1P50221 254 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 GRM7Q14831 915 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 FBXW5Q969U6 566 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 TGM1P22735 817 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PCOLCEQ15113 449 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 BTBD2Q9BX70 525 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PPFIA2O75334 1257 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 PDE6AP16499 860 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 MRE11P49959 708 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 HERVK_113P62684 666 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 OSTM1Q86WC4 334 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 BTBD7Q9P203 1132 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 A0A0G2JNJ9 132 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 GSTA4O15217 222 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 CYP27B1O15528 508 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 KLF4O43474 513 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 AMY2AP04746 511 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 KRT15P19012 456 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 AMY2BP19961 511 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 MC4RP32245 332 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA4-211ENST00000490435 ECE1P42892 770 aa6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms