RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa27.5■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 DTNBO60941 627 aa27.49■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 IGBP1P78318 339 aa27.49■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 IKBKEQ14164 716 aa27.49■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 TNFRSF25Q93038 417 aa27.49■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 GBF1Q92538 1859 aa27.49■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 KCNJ6P48051 423 aa27.48■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 NR5A1Q13285 461 aa27.48■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 MBTPS1Q14703 1052 aa27.48■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 CKAP2LQ8IYA6 745 aa27.48■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 FAM184AQ8NB25 1140 aa27.48■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 C8orf76Q96K31 380 aa27.48■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 GABBR1Q9UBS5 961 aa27.48■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 CEP131Q9UPN4 1083 aa27.48■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 EVPLQ92817 2033 aa27.48■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 RUFY4Q6ZNE9 571 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 Q7L0L9 218 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 NME8Q8N427 588 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 TIFAQ96CG3 184 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 PBX4Q9BYU1 374 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 SEMA6BQ9H3T3 888 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 UNC45AQ9H3U1 944 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 KCNMB3Q9NPA1 279 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 KIF3AQ9Y496 699 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 BTBD18B2RXH4 712 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 IER5Q5VY09 327 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 B3GNT9Q6UX72 402 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 MIER3Q7Z3K6 550 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 SEPT8Q92599 483 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 APBB2Q92870 758 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 NRBP2Q9NSY0 501 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 MICAL3Q7RTP6 2002 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD1-211ENST00000489379 GRXCR1A8MXD5 290 aa27.45■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 SLC37A4O43826 429 aa27.45■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 CTSHP09668 335 aa27.45■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 ATP4AP20648 1035 aa27.45■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 MTHFD1LQ6UB35 978 aa27.45■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 SLFN12Q8IYM2 578 aa27.45■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 DNAJB3Q8WWF6 145 aa27.45■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 MYO9BQ13459 2157 aa27.45■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 KIF28PB7ZC32 967 aa27.44■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 M0QZ92 97 aa27.44■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 MARCH6O60337 910 aa27.44■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 KLRC1P26715 233 aa27.44■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 DBF4BQ8NFT6 615 aa27.44■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa27.44■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 SQORQ9Y6N5 450 aa27.44■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 CHMP2AO43633 222 aa27.43■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 CHRNA1P02708 482 aa27.43■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 WDR5P61964 334 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 MGAT3Q09327 533 aa27.43■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 PPP2R5CQ13362 524 aa27.43■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 USP38Q8NB14 1042 aa27.43■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 BACH2Q9BYV9 841 aa27.43■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 MAGEB2O15479 319 aa27.42■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa27.42■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 ZNF576Q9H609 170 aa27.42■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 SIP14410 1827 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 OATP04181 439 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 PBX2P40425 430 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 FOSBP53539 338 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 HERC6Q8IVU3 1022 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 ZNF710Q8N1W2 664 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 GJA10Q969M2 543 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 TMX3Q96JJ7 454 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 SLC28A3Q9HAS3 691 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 CDY2AQ9Y6F7 541 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa27.41■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 PTPRSQ13332 1948 aa27.4■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 ZBTB42B2RXF5 422 aa27.4■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 PRKCEQ02156 737 aa27.4■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 HAS1Q92839 578 aa27.4■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.4■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 TRPV2Q9Y5S1 764 aa27.4■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 FAM205CA6NFA0 338 aa27.39■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 ZNF862O60290 1169 aa27.39■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 GUCY1B3Q02153 619 aa27.39■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 XKR3Q5GH77 459 aa27.39■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 POTEDQ86YR6 584 aa27.39■■□□□ 1.98
EHD1-211ENST00000489379 FAM161BQ96MY7 647 aa27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms