RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 NOBOXO60393 691 aa8.62□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 GLRBP48167 497 aa8.62□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 RGL3Q3MIN7 710 aa8.62□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 MCTP2Q6DN12 878 aa8.62□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.62□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 SCYL1Q96KG9 808 aa8.62□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 GBP4Q96PP9 640 aa8.62□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.62□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 KCND1Q9NSA2 647 aa8.62□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 KRT37O76014 449 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 F2P00734 622 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 SCNN1BP51168 640 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 BORAQ6PGQ7 559 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 NME9Q86XW9 330 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 STPG3Q8N7X2 389 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 HIPK4Q8NE63 616 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 CALML6Q8TD86 181 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 ASB15Q8WXK1 588 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 BTBD2Q9BX70 525 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 BTBD7Q9P203 1132 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.61□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 MROH6A6NGR9 719 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 H0Y858 1186 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 KPNA6O60684 536 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 KNG1P01042 644 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 INHBBP09529 407 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 KIF11P52732 1056 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 OCRLQ01968 901 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 RTP5Q14D33 572 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 PASD1Q8IV76 773 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 MTFR1LQ9H019 292 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 FBXO10Q9UK96 956 aa8.6□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.59□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.59□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 MMEP08473 750 aa8.59□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.59□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
USP34-216ENST00000487547 CUTAO60888 179 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 IL18BPO95998 194 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 COL6A1P12109 1028 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 ECE1P42892 770 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 ADCY1Q08828 1119 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 LGI4Q8N135 537 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 SYT8Q8NBV8 401 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 OR2W6PQ8NHA6 318 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 UCKL1Q9NWZ5 548 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.58□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.57□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 PDE8AO60658 829 aa8.57□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 STILQ15468 1287 aa8.57□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.57□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.57□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.57□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 TEPSINQ96N21 525 aa8.57□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 A0A087X0B3 334 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 FAM83GA6ND36 823 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 KLHL18O94889 574 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 HOXA5P20719 270 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 NFATC3Q12968 1075 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 SURF1Q15526 300 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 PHF19Q5T6S3 580 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 Q6ZUG5 572 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 OR10A5Q9H207 317 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 OXSMQ9NWU1 459 aa8.56□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 RASSF10A6NK89 507 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 DVL2O14641 736 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 POLD1P28340 1107 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 DSG1Q02413 1049 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 EPHA7Q15375 998 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 EFHBQ8N7U6 833 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 AJUBAQ96IF1 538 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 FOXB1Q99853 325 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 ADAM29Q9UKF5 820 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.55□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
USP34-216ENST00000487547 MPIG6BO95866 241 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms