RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486679.2

MYCBP2-208, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 545 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-208	ENST00000486679	VASN	Q6EMK4	673 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	PTPRN2	Q92932	1015 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM209	Q96SK2	561 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	NCAN	O14594	1321 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	CYP7B1	O75881	506 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	LRG1	P02750	347 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	LTF	P02788	710 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	ST5	P78524	1137 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	ADAM9	Q13443	819 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	RASA3	Q14644	834 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	RTP5	Q14D33	572 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	HOMER1	Q86YM7	354 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	CXorf38	Q8TB03	319 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	APPBP2	Q92624	585 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	ABCC2	Q92887	1545 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	PZP	P20742	1482 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	MBD5	Q9P267	1494 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	NOBOX	O60393	691 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	FBXO21	O94952	628 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	BORA	Q6PGQ7	559 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	WRNIP1	Q96S55	665 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	DNAJC7	Q99615	494 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	CD244	Q9BZW8	370 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	MROH6	A6NGR9	719 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRT15	P19012	456 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	IL13	P35225	146 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	GABRE	P78334	506 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	PHF19	Q5T6S3	580 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	EXOC2	Q96KP1	924 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	FANCL	Q9NW38	375 aa		6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF536	O15090	1300 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	NAT1	P18440	290 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	GLRB	P48167	497 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	DNM2	P50570	870 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	KCTD1	Q719H9	257 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	FBXW5	Q969U6	566 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	PREX2	Q70Z35	1606 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	GSTA4	O15217	222 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	PYGM	P11217	842 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAH	P16930	419 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	TONSL	Q96HA7	1378 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	CRTAM	O95727	393 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	CKM	P06732	381 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	CRY1	Q16526	586 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MYCBP2-208	ENST00000486679	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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