RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-208ENST00000484874 PTGDRQ13258 359 aa20.34■□□□□ 0.85
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CNKSR1-208ENST00000484874 LXNQ9BS40 222 aa20.28■□□□□ 0.84
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CNKSR1-208ENST00000484874 POTEMA6NI47 508 aa20.27■□□□□ 0.84
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