RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 ATG7O95352 703 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-212ENST00000484841 CTNNB1P35222 781 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-212ENST00000484841 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-212ENST00000484841 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-212ENST00000484841 ZNF302Q9NR11 478 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-212ENST00000484841 COL4A6Q14031 1691 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-212ENST00000484841 CYP3A4P08684 503 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 CD52P31358 61 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 KRT76Q01546 638 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PAK2Q13177 524 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PHKBQ93100 1093 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 FAM86B1E9PN63 330 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 RB1P06400 928 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 KLRC1P26715 233 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 FBXL16Q8N461 479 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 BANK1Q8NDB2 785 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 SAMM50Q9Y512 469 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 CCNE2O96020 404 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 STAG3L1P0CL83 205 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 ODR4Q5SWX8 454 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 UIMC1Q96RL1 719 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 GINS2Q9Y248 185 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 COL1A2P08123 1366 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 NID2Q14112 1375 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 TRANK1O15050 2925 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PSAPP07602 524 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 KCNA5P22460 613 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PRR16Q569H4 304 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PADI3Q9ULW8 664 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 NEFLP07196 543 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 BMPR1AP36894 532 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 NLRP5P59047 1200 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PKN1Q16512 942 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 RUFY3Q7L099 469 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 TTC3P53804 2025 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 CPLX1O14810 134 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 DGKIO75912 1065 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 IFNAR1P17181 557 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 EVPLQ92817 2033 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PPFIA3O75145 1194 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.83■■□□□ 1.25
ACTB-212ENST00000484841 VCANP13611 3396 aa22.83■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 RPS6KA5O75582 802 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-212ENST00000484841 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms