RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 PTH1RQ03431 593 aa18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 ANGPT1Q15389 498 aa18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 CES5AQ6NT32 575 aa18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 TICAM2Q86XR7 235 aa18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 POMKQ9H5K3 350 aa18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 CDH22Q9UJ99 828 aa18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa18.13■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 M0QZ92 97 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 PAK2Q13177 524 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 KCNC3Q14003 757 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 GRIK4Q16099 956 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 IQCA1Q86XH1 822 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 SAMD3Q8N6K7 520 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 NECTIN4Q96NY8 510 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 DMXL1Q9Y485 3027 aa18.12■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 KAT6AQ92794 2004 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 DNAH14Q0VDD8 3507 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 TBKBP1A7MCY6 615 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 HIP1O00291 1037 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 FSCN2O14926 492 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 SGSM2O43147 1006 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 FIBPO43427 364 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 LMNAP02545 664 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 POLR2MP0CAP2 368 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 MARK3P27448 753 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 APOBRQ0VD83 1088 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 IER5Q5VY09 327 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC105Q8IYK2 499 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 TCF25Q9BQ70 676 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 HINFPQ9BQA5 517 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 PADI3Q9ULW8 664 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 TELO2Q9Y4R8 837 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 ZMYM6O95789 1325 aa18.11■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 NEDD4P46934 1319 aa18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 STAM2O75886 525 aa18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 IGBP1P78318 339 aa18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 CASP10Q92851 521 aa18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 SEMA4AQ9H3S1 761 aa18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 RTEL1Q9NZ71 1219 aa18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 LIMD1Q9UGP4 676 aa18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 SQORQ9Y6N5 450 aa18.1■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 ZBTB5O15062 677 aa18.09■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 AOC1P19801 751 aa18.09■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 ITIH3Q06033 890 aa18.09■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa18.09■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 ADAM7Q9H2U9 754 aa18.09■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.09■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 MYO10Q9HD67 2058 aa18.08■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 DOCK5Q9H7D0 1870 aa18.08■□□□□ 0.49
SRPRB-204ENST00000484684 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 PI15O43692 258 aa18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 MTHFRP42898 656 aa18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 SARSP49591 514 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 TMEM62Q0P6H9 643 aa18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 SEMA3FQ13275 785 aa18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 DTWD2Q8NBA8 298 aa18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 RTP3Q9BQQ7 232 aa18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 ERAP1Q9NZ08 941 aa18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 HCSTQ9UBK5 93 aa18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 LZTS1Q9Y250 596 aa18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF292O60281 2723 aa18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 EPG5Q9HCE0 2579 aa18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 NCOR2Q9Y618 2525 aa18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 HIDE1A8MVS5 230 aa18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 LAG3P18627 525 aa18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 MARCH8Q5T0T0 291 aa18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 HOMER1Q86YM7 354 aa18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 GLG1Q92896 1179 aa18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.07■□□□□ 0.48
SRPRB-204ENST00000484684 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms