RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480996.1

KDM4C-208, Transcript of lysine demethylase 4C, human

TSL 3

Gene KDM4C, Length 405 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4C-208	ENST00000480996	TM4SF4	P48230	202 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	KIF11	P52732	1056 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TRIM14	Q14142	442 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	JADE3	Q92613	823 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	RASA4B	C9J798	803 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996		H7BY64	318 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	RASA4	O43374	803 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	NPHS1	O60500	1241 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	AGXT	P21549	392 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	GALE	Q14376	348 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	USP45	Q70EL2	814 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ORAI2	Q96SN7	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TIMM44	O43615	452 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	MAFK	O60675	156 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	NDUFS2	O75306	463 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TUSC2	O75896	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	DGKI	O75912	1065 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	LDHC	P07864	332 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	PEX2	P28328	305 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ADM	P35318	185 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	UGT8	Q16880	541 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	GAB4	Q2WGN9	574 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	HYI	Q5T013	277 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KDM4C-208	ENST00000480996	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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