RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 CEP55Q53EZ4 464 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 SFMBT2Q5VUG0 894 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 RIT2Q99578 217 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 FUT8Q9BYC5 575 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 ODF2LQ9ULJ1 636 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TRPM7Q96QT4 1865 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 CLRN2A0PK11 232 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TOMM70O94826 608 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 SLITRK3O94933 977 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 NR2F2P24468 414 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 EPHA7Q15375 998 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 RINT1Q6NUQ1 792 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 C1orf186Q6ZWK4 172 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 SPICE1Q8N0Z3 855 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 NMRK2Q9NPI5 230 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 BTNL10A8MVZ5 291 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 RAD17O75943 681 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 ICAM1P05362 532 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 CASP5P51878 434 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TNIP1Q15025 636 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 IQCEQ6IPM2 695 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 LPAR1Q92633 364 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TANGO6Q9C0B7 1094 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 ASTN1O14525 1302 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TBCAO75347 108 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 C10orf76Q5T2E6 689 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 NELFCDQ8IXH7 590 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 MKNK1Q9BUB5 465 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 RRAGCQ9HB90 399 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TBC1D7Q9P0N9 293 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TSKSQ9UJT2 592 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 LONRF2Q1L5Z9 754 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 CYP2W1Q8TAV3 490 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 RUSC1Q9BVN2 902 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 BHMT2Q9H2M3 363 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 DEF6Q9H4E7 631 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 SMCHD1A6NHR9 2005 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 WDR46O15213 610 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 AKR1B10O60218 316 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 AFPP02771 609 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 RPS12P25398 132 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 USP14P54578 494 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 KCNH2Q12809 1159 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 DOCK1Q14185 1865 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 LDHDQ86WU2 507 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 ALS2CR12Q96Q35 445 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 NACC1Q96RE7 527 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 PNKPQ96T60 521 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 EPC1Q9H2F5 836 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 SNX12Q9UMY4 172 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 PHF20L1A8MW92 1017 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TLR2O60603 784 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 SASH3O75995 380 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 DDNO94850 711 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 CFBP00751 764 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 GUCY2CP25092 1073 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 C1QTNF8P60827 252 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 CYP27A1Q02318 531 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 MYBPC2Q14324 1141 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 BORCS6Q96GS4 357 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 MYBP10242 640 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 MAPTP10636 758 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 MAGEA1P43355 309 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 CIAPIN1Q6FI81 312 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 MXRA8Q9BRK3 442 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TEKT3Q9BXF9 490 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM39BQ9GZU3 492 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF536O15090 1300 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 NR3C1P04150 777 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TCP1P17987 556 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 CXCL9Q07325 125 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 SLC18A3Q16572 532 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 DYDC2Q96IM9 177 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 STRA6Q9BX79 667 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 HACL1Q9UJ83 578 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 UTRNP46939 3433 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 GAS7O60861 476 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 PRKCIP41743 596 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 TERF2Q15554 542 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 CCDC174Q6PII3 467 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 HDXQ7Z353 690 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 FIZ1Q96SL8 496 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRF-212ENST00000477970 L1RE1Q9UN81 338 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.4 ms