RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 STK24Q9Y6E0 443 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 POTEB3A0JP26 581 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 SLC26A4O43511 780 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 OATP04181 439 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 MUTP22033 750 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 ITGA7Q13683 1181 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 KRT79Q5XKE5 535 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 POTEBQ6S5H4 581 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 TPH2Q8IWU9 490 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 GRB10Q13322 594 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 HIC1Q14526 733 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 POTEGQ6S5H5 508 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 CABP7Q86V35 215 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 FAM167AQ96KS9 214 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 PNMA5Q96PV4 448 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 TMEM150BA6NC51 233 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 UBA7P41226 1012 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 CDK7P50613 346 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 XKR3Q5GH77 459 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 ANO5Q75V66 913 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 LRRC15Q8TF66 581 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 CEP89Q96ST8 783 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-210ENST00000477812 ARVCFO00192 962 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB39O15060 712 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 HBP1O60381 514 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 ADAM17P78536 824 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 RESP18Q5W5W9 173 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 ADALQ6DHV7 355 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 TRPC6Q9Y210 931 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 A0A087X0B3 334 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 INSRRP14616 1297 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 CHMP4BP1P59074 171 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 PPFIA1Q13136 1202 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 KCNK18Q7Z418 384 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 COL1A2P08123 1366 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PQ27 194 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PQ64 194 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PQD8 194 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.164e-22■□□□□ 8.8
ACTB-210ENST00000477812 CMA1P23946 247 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 GRIK4Q16099 956 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 C7orf31Q8N865 590 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 NRCAMQ92823 1304 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 ARID2Q68CP9 1835 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 A0A087WWV3 80 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 PLCG1P19174 1290 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 NACC1Q96RE7 527 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 SETD4Q9NVD3 440 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-210ENST00000477812 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
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