RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473661.5

TTLL3-225, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 5

Gene TTLL3, Length 3,811 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-225	ENST00000473661	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661		A0A0G2JMZ2	1700 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	HOXD10	P28358	340 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	STAT5B	P51692	787 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	SLC12A3	P55017	1021 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	PAK1	Q13153	545 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	KCND2	Q9NZV8	630 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	ZBTB39	O15060	712 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	XKR3	Q5GH77	459 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	APBA2	Q99767	749 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	LYPLA2	O95372	231 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	GAP43	P17677	238 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	VEGFB	P49765	207 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	COASY	Q13057	564 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	MORN1	Q5T089	497 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	DRC7	Q8IY82	874 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	IKBKB	O14920	756 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	PRKCE	Q02156	737 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	NELFB	Q8WX92	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	TSG101	Q99816	390 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	REEP2	Q9BRK0	252 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	BICDL2	A1A5D9	508 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	KLRC4	O43908	158 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	COPS5	Q92905	334 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	FAM167A	Q96KS9	214 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	ARIH2	O95376	493 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	SERPINC1	P01008	464 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	BMP6	P22004	513 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	PRCP	P42785	496 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	TNFAIP2	Q03169	654 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	MTERF2	Q49AM1	385 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	PARVG	Q9HBI0	331 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	CYP2C19	P33261	490 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	RARRES1	P49788	294 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	NPEPPS	P55786	919 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	HTRA3	P83110	453 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	STK4	Q13043	487 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	GIT2	Q14161	759 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	IQCB1	Q15051	598 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	UGCG	Q16739	394 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	POLD4	Q9HCU8	107 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	TPM3	P06753	285 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	HOXC6	P09630	235 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	ODR4	Q5SWX8	454 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	TRPC6	Q9Y210	931 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	SFI1	A8K8P3	1242 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	CNGA1	P29973	690 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	CHMP4BP1	P59074	171 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-225	ENST00000473661	HPS3	Q969F9	1004 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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