RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 ADCY8P40145 1251 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 IL13RA1P78552 427 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 ASB15Q8WXK1 588 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 INCENPQ9NQS7 918 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 H0Y858 1186 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 CSF2RBP32927 897 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 IRF9Q00978 393 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 TKFCQ3LXA3 575 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 DLG3Q92796 817 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 GBP4Q96PP9 640 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.09□□□□□ -1.43
RABGGTB-206ENST00000467748 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 K7ESM1 405 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 TRAF5O00463 557 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 DVL2O14641 736 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 LAMTOR5O43504 91 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 CHGBP05060 677 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 APPP05067 770 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 IGFALSP35858 605 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 HERVK_113P62684 666 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 NFKB2Q00653 900 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 GALNT8Q9NY28 637 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 FOXP2O15409 715 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 ASLP04424 464 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 JMJD7P0C870 316 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 EFEMP1Q12805 493 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 HIPK4Q8NE63 616 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 AJUBAQ96IF1 538 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 KATNBL1Q9H079 304 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 FANCLQ9NW38 375 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 NPTXRO95502 500 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 RRADP55042 308 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP2CBP62714 309 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP2CAP67775 309 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 CD83Q01151 205 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 CHST14Q8NCH0 376 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 BOCQ9BWV1 1114 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 JADE2Q9NQC1 790 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM83GA6ND36 823 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 GPR42O15529 346 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 HIP1RO75146 1068 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 POLD1P28340 1107 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 ECE1P42892 770 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNQ1P51787 676 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 KANK2Q63ZY3 851 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 GGNQ86UU5 652 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 WNK4Q96J92 1243 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 LOXL4Q96JB6 756 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 B4E1Z4 1266 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 SDHAP31040 664 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 KIF11P52732 1056 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 EPHB4P54760 987 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 ICAM4Q14773 271 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 STILQ15468 1287 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 HOMER1Q86YM7 354 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 C8orf49Q96NF6 230 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 GNRHR2Q96P88 292 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 BTBD2Q9BX70 525 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-206ENST00000467748 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.04□□□□□ -1.44
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